addspecies (model, compartment)

Создайте разновидности, возражают и добавляют к объекту отсека в объекте модели

Синтаксис

speciesObj = addspecies(compObj, 'NameValue') speciesObj = addspecies(compObj, 'NameValue', InitialAmountValue) speciesObj = addspecies(modelObj, 'NameValue') speciesObj = addspecies(modelObj, 'NameValue', InitialAmountValue) speciesObj = addspecies(...'PropertyName', PropertyValue...)

Аргументы

`compObj`	`Compartment object`.
`modelObj`	`Model object` содержа нуль или один отсек.
`NameValue`	Назовите для объекта разновидностей. Введите вектор символов, уникальный среди разновидностей в `modelObj` или `compObj`. Объекты разновидностей идентифицированы по наименованию в `Event`, `ReactionRate`, и `Rule` свойства. Для получения информации об именовании разновидностей смотрите `Name`. Можно использовать функциональный `sbioselect` найти объект с определенным `Name` значение свойства.
`InitialAmountValue`	Начальное значение суммы для объекта разновидностей. Введите `double`. Положительное вещественное число, значением по умолчанию является `0`.
`PropertyName`	Введите имя допустимого свойства. Допустимые имена свойства перечислены в Сводных данных Свойства.
`PropertyValue`	Введите значение для свойства, заданного в `PropertyName`. Допустимые значения свойств перечислены на каждой странице с описанием свойства.

Описание

speciesObj = addspecies(compObj, 'NameValue') создает speciesObj, объект разновидностей, и добавляет его в compObj, объект отсека. В объекте разновидностей этот метод присваивает NameValue к Name свойство, compObj присвоений к Parent свойство и присвоения 0 к InitialAmount свойство. В объекте отсека этот метод добавляет объект разновидностей в Species свойство.

speciesObj = addspecies(compObj, 'NameValue', InitialAmountValue), в дополнение к вышеупомянутому, InitialAmountValue присвоений к InitialAmount свойство для объекта разновидностей.

speciesObj = addspecies(modelObj, 'NameValue') создает speciesObj, объект разновидностей, и добавляет его в compObj, объект отсека в modelObjA Model object. Если modelObj не содержит отсеков, это создает compObj с Name свойство 'unnamed'. В объекте разновидностей этот метод присваивает NameValue к Name свойство, compObj присвоений к Parent свойство и присвоения 0 к InitialAmount свойство. В объекте отсека этот метод добавляет объект разновидностей в Species свойство.

speciesObj = addspecies(modelObj, 'NameValue', InitialAmountValue), в дополнение к вышеупомянутому, InitialAmountValue присвоений к InitialAmount свойство для объекта разновидностей.

Можно также добавить разновидность в реакцию с помощью методов addreactant и addproduct.

Объект разновидностей должен иметь уникальное имя на уровне, на котором он создается. Например, объект отсека не может содержать два объекта разновидностей под названием H2O. Однако другой отсек может иметь разновидность под названием H2O.

Просмотрите свойства для объекта разновидностей с get команда, и изменяет свойства для объекта разновидностей с set команда. Можно просмотреть сводную таблицу объектов разновидностей в отсеке (compObj) с get(compObj, 'Species') или свойства первых разновидностей с get(compObj.Species(1)).

speciesObj = addspecies(...'PropertyName', PropertyValue...) задает дополнительные свойства. Имя свойства / пары значения свойства может быть в любом формате, поддержанном функциональным set (например, пары "имя-значение", структуры и пары массива ячеек значения имени). Сводные данные свойства на этой странице показывают список свойств.

Если существует больше чем один объект отсека (compObj) в модели необходимо квалифицировать имя разновидностей с именем отсека. Например, cell.glucose обозначает, что вы хотите поместить разновидности под названием glucose в отсек под названием cell. Кроме того, если отсек под названием cell не существует, процесс добавления, что реакция создает отсек и называет его cell.

Если вы меняете имя разновидности, вы должны сконфигурировать все применимые элементы, такие как события и постановляете, что используют разновидности, любой заданный пользователями ReactionRate, или кинетическое свойство объекта закона SpeciesVariableNames. Используйте метод setspecies сконфигурировать SpeciesVariableNames.

Обновить имена разновидностей в SimBiology^® графический интерфейс пользователя, доступ каждая соответствующая панель через Project Explorer. Можно также использовать функцию Find, чтобы определить местоположение имен, которые вы хотите обновить. Панель Output открывается результатами Find. Дважды кликните строку результата, чтобы перейти к местоположению компонента модели.

Имена разновидностей автоматически обновляются для реакций то использование MassAction кинетический закон.

Сводные данные метода

Методы для объектов разновидностей

copyobj	Скопируйте объект SimBiology и его дочерние элементы
delete	Объект Delete SimBiology
display	Отобразите сводные данные объекта SimBiology
findUsages	Узнайте, как разновидность, параметр или отсек используются в модели
get	Получите свойства объектов SimBiology
move	Переместите разновидности SimBiology или объект параметра к новому родительскому элементу
rename	Переименуйте выражения обновления и объект
set	Установите свойства объектов SimBiology

Сводные данные свойства

Свойства для объектов разновидностей

Active	Укажите на объект в использовании в процессе моделирования
BoundaryCondition	Укажите на граничное условие разновидностей
Constant	Задайте переменную или постоянную сумму разновидностей, значение параметров или способность отсека
ConstantAmount	Задайте переменную или постоянную сумму разновидностей
InitialAmount	Сумма начальной буквы разновидностей
InitialAmountUnits	Модули суммы начальной буквы разновидностей
Name	Задайте имя объекта
Notes	Текст HTML, описывающий объект SimBiology
Parent	Укажите на родительский объект
Tag	Задайте метку для объекта SimBiology
Type	Отобразите тип объекта SimBiology
Units	Модули для суммы разновидностей, значения параметров, способности отсека, заметного выражения
UserData	Задайте данные, чтобы сопоставить с объектом
Value	Значение разновидностей, отсека или объекта параметра

Примеры

Добавьте две разновидности в модель, где каждый - реагент, и другой фермент, катализирующий реакцию.

Создайте объект модели под названием my_model и добавьте объект отсека.
```
modelObj = sbiomodel ('my_model');
compObj = addcompartment(modelObj, 'comp1');
```

Добавьте два объекта разновидностей, названные glucose_6_phosphate и glucose_6_phosphate_dehydrogenase.

speciesObj1 = addspecies (compObj, 'glucose_6_phosphate');
speciesObj2 = addspecies (compObj, ...
                         'glucose_6_phosphate_dehydrogenase');

Установите начальную сумму glucose_6_phosphate к 100 и проверьте.
```
set (speciesObj1, 'InitialAmount',100);
get (speciesObj1, 'InitialAmount')
```
MATLAB возвращается:
```
ans =

   100
```

Используйте get отметить тот modelObj содержит объектный массив разновидностей.

get(compObj, 'Species')

MATLAB возвращается:

SimBiology Species Array

Index: Name:                             InitialAmount: InitialAmountUnits:
 1     glucose_6_phosphate                100               
 2     glucose_6_phosphate_dehydrogenase  0

Получите информацию о первых разновидностях в массиве.

get(compObj.Species(1))
            Annotation: ''
     BoundaryCondition: 0
        ConstantAmount: 0
         InitialAmount: 100
    InitialAmountUnits: ''
                  Name: 'glucose_6_phosphate'
                 Notes: ''
                Parent: [1x1 SimBiology.Compartment]
                   Tag: ''
                  Type: 'species'
              UserData: []

Введен в R2006a

Документация