elementNames

Класс: bioma.data. ExptData
Пакет: bioma.data

Получите или имена элемента набора объектов DataMatrix в объекте ExptData

Синтаксис

ElmtNames = elementNames(EDObj) ElmtNames = elementNames(EDObj, Subset) NewEDObj = elementNames(EDObj, Subset, NewElmtNames)

Описание

ElmtNames = elementNames(EDObj) возвращает массив ячеек из символьных векторов, задающий имена элементов всех элементов данных (объекты DataMatrix) сохраненный в объекте ExptData.

ElmtNames = elementNames(EDObj, Subset) возвращает массив ячеек из символьных векторов, задающий имена элементов подмножества элементов данных (объекты DataMatrix) сохраненный в объекте ExptData.

NewEDObj = elementNames(EDObj, Subset, NewElmtNames) заменяет имена элементов элементов данных (объекты DataMatrix) заданный Subset в EDObj, объекте ExptData, с NewElmtNames, и возвращает NewEDObj, новый объект ExptData.

Входные параметры

EDObj

Объект класса bioma.data.ExptData.

Subset

Одно из следующих, чтобы задать имена элементов подмножества элементов данных (объекты DataMatrix) в объекте ExptData:

Вектор символов, задающий имя элемента
Массив ячеек из символьных векторов, задающий имена элементов
Положительное целое число
Вектор положительных целых чисел
Логический вектор

NewElmtNames

Новые имена элементов для определенных элементов данных (объекты DataMatrix) в объекте ExptData, заданном одним из следующего:

Числовой вектор
Вектор символов или массив ячеек из символьных векторов
Вектор символов, который elementNames использует в качестве префикса для имен элементов с числами элемента, добавленными к префиксу
Логический true или false (значение по умолчанию). Если true, elementNames присваивает уникальные имена элементов с помощью формата Elmt1, Elmt2, и т.д.

Число элементов в NewElmtNames должно равняться числу элементов, заданному Subset.

Выходные аргументы

`ElmtNames`	Массив ячеек из символьных векторов, задающий имена элементов всех или некоторые элементы данных (объекты DataMatrix) в объекте ExptData.
`NewEDObj`	Объект класса `bioma.data.ExptData`, возвращенного после заменяющий имена элементов определенных элементов данных (объекты DataMatrix).

Примеры

Создайте объект ExptData, и затем получите имена элементов объектов DataMatrix от него:

% Import bioma.data package to make constructor functions
% available
import bioma.data.*
% Create DataMatrix object from .txt file containing 
% expression values from microarray experiment
dmObj = DataMatrix('File', 'mouseExprsData.txt');
% Construct ExptData object
EDObj = ExptData(dmObj);
% Retrieve element names of DataMatrix objects
ENames = elementNames(EDObj);

Темы

Представление значений данных выражения в объектах ExptData

Документация