elementNames

Класс: bioma.data. ExptData
Пакет: bioma.data

Получите или имена элемента набора объектов DataMatrix в объекте ExptData

Синтаксис

ElmtNames = elementNames(EDObj)
ElmtNames = elementNames(EDObj, Subset)
NewEDObj = elementNames(EDObj, Subset, NewElmtNames)

Описание

ElmtNames = elementNames(EDObj) возвращает массив ячеек из символьных векторов, задающий имена элементов всех элементов данных (объекты DataMatrix) сохраненный в объекте ExptData.

ElmtNames = elementNames(EDObj, Subset) возвращает массив ячеек из символьных векторов, задающий имена элементов подмножества элементов данных (объекты DataMatrix) сохраненный в объекте ExptData.

NewEDObj = elementNames(EDObj, Subset, NewElmtNames) заменяет имена элементов элементов данных (объекты DataMatrix) заданный Subset в EDObj, объекте ExptData, с NewElmtNames, и возвращает NewEDObj, новый объект ExptData.

Входные параметры

EDObj

Объект класса bioma.data.ExptData.

Subset

Одно из следующих, чтобы задать имена элементов подмножества элементов данных (объекты DataMatrix) в объекте ExptData:

  • Вектор символов, задающий имя элемента

  • Массив ячеек из символьных векторов, задающий имена элементов

  • Положительное целое число

  • Вектор положительных целых чисел

  • Логический вектор

NewElmtNames

Новые имена элементов для определенных элементов данных (объекты DataMatrix) в объекте ExptData, заданном одним из следующего:

  • Числовой вектор

  • Вектор символов или массив ячеек из символьных векторов

  • Вектор символов, который elementNames использует в качестве префикса для имен элементов с числами элемента, добавленными к префиксу

  • Логический true или false (значение по умолчанию). Если true, elementNames присваивает уникальные имена элементов с помощью формата Elmt1, Elmt2, и т.д.

Число элементов в NewElmtNames должно равняться числу элементов, заданному Subset.

Выходные аргументы

ElmtNames

Массив ячеек из символьных векторов, задающий имена элементов всех или некоторые элементы данных (объекты DataMatrix) в объекте ExptData.

NewEDObj

Объект класса bioma.data.ExptData, возвращенного после заменяющий имена элементов определенных элементов данных (объекты DataMatrix).

Примеры

Создайте объект ExptData, и затем получите имена элементов объектов DataMatrix от него:

% Import bioma.data package to make constructor functions
% available
import bioma.data.*
% Create DataMatrix object from .txt file containing 
% expression values from microarray experiment
dmObj = DataMatrix('File', 'mouseExprsData.txt');
% Construct ExptData object
EDObj = ExptData(dmObj);
% Retrieve element names of DataMatrix objects
ENames = elementNames(EDObj);