featureNames

Класс: bioma.data. ExptData
Пакет: bioma.data

Получите или определите имена функции в объекте ExptData

Синтаксис

FeatNames = featureNames(EDObj) FeatNames = featureNames(EDObj, Subset) NewESObj = featureNames(EDObj, Subset, NewFeatNames)

Описание

FeatNames = featureNames(EDObj) возвращает массив ячеек из символьных векторов, задающий все имена функции в объекте ExptData.

FeatNames = featureNames(EDObj, Subset) возвращает массив ячеек из символьных векторов, задающий подмножество имена функции в объекте ExptData.

NewESObj = featureNames(EDObj, Subset, NewFeatNames) заменяет имена функции, заданные Subset в EDObj, объекте ExptData, с NewFeatNames, и возвращает NewEDObj, новый объект ExptData.

Входные параметры

EDObj

Объект класса bioma.data.ExptData.

Subset

Одно из следующих, чтобы задать подмножество функции называет в объекте ExptData:

Вектор символов, задающий имя функции
Массив ячеек из символьных векторов, задающий имена функции
Положительное целое число
Вектор положительных целых чисел
Логический вектор

NewFeatNames

Новая возможность называет для определенных имен функции в объекте ExptData, заданном одним из следующего:

Числовой вектор
Вектор символов или массив ячеек из символьных векторов
Вектор символов, который featureNames использует в качестве префикса для имен функции с числами функции, добавленными к префиксу
Логический true или false (значение по умолчанию). Если true, featureNames присваивает имена уникальной функции с помощью формата Feature1, Feature2, и т.д.

Количество имен функции в NewFeatNames должно равняться количеству функций, заданных Subset.

Выходные аргументы

`FeatNames`	Массив ячеек из символьных векторов, задающий все или часть функции, называет в объекте ExptData. Имена функции являются именами строки в объектах DataMatrix в объекте ExptData.
`NewEDObj`	Объект класса `bioma.data.ExptData`, возвращенного после заменяющий определенные имена функции.

Примеры

Создайте объект ExptData, и затем получите имена функции из него:

% Import bioma.data package to make constructor functions
% available
import bioma.data.*
% Create DataMatrix object from .txt file containing 
% expression values from microarray experiment
dmObj = DataMatrix('File', 'mouseExprsData.txt');
% Construct ExptData object
EDObj = ExptData(dmObj);
% Retrieve feature names
FNames = featureNames(EDObj);

Темы

Представление значений данных выражения в объектах ExptData

Документация