featureNames

Класс: bioma.data. ExptData
Пакет: bioma.data

Получите или определите имена функции в объекте ExptData

Синтаксис

FeatNames = featureNames(EDObj)
FeatNames = featureNames(EDObj, Subset)
NewESObj = featureNames(EDObj, Subset, NewFeatNames)

Описание

FeatNames = featureNames(EDObj) возвращает массив ячеек из символьных векторов, задающий все имена функции в объекте ExptData.

FeatNames = featureNames(EDObj, Subset) возвращает массив ячеек из символьных векторов, задающий подмножество имена функции в объекте ExptData.

NewESObj = featureNames(EDObj, Subset, NewFeatNames) заменяет имена функции, заданные Subset в EDObj, объекте ExptData, с NewFeatNames, и возвращает NewEDObj, новый объект ExptData.

Входные параметры

EDObj

Объект класса bioma.data.ExptData.

Subset

Одно из следующих, чтобы задать подмножество функции называет в объекте ExptData:

  • Вектор символов, задающий имя функции

  • Массив ячеек из символьных векторов, задающий имена функции

  • Положительное целое число

  • Вектор положительных целых чисел

  • Логический вектор

NewFeatNames

Новая возможность называет для определенных имен функции в объекте ExptData, заданном одним из следующего:

  • Числовой вектор

  • Вектор символов или массив ячеек из символьных векторов

  • Вектор символов, который featureNames использует в качестве префикса для имен функции с числами функции, добавленными к префиксу

  • Логический true или false (значение по умолчанию). Если true, featureNames присваивает имена уникальной функции с помощью формата Feature1, Feature2, и т.д.

Количество имен функции в NewFeatNames должно равняться количеству функций, заданных Subset.

Выходные аргументы

FeatNames

Массив ячеек из символьных векторов, задающий все или часть функции, называет в объекте ExptData. Имена функции являются именами строки в объектах DataMatrix в объекте ExptData.

NewEDObj

Объект класса bioma.data.ExptData, возвращенного после заменяющий определенные имена функции.

Примеры

Создайте объект ExptData, и затем получите имена функции из него:

% Import bioma.data package to make constructor functions
% available
import bioma.data.*
% Create DataMatrix object from .txt file containing 
% expression values from microarray experiment
dmObj = DataMatrix('File', 'mouseExprsData.txt');
% Construct ExptData object
EDObj = ExptData(dmObj);
% Retrieve feature names
FNames = featureNames(EDObj);