Exponenta Banner

getReference

Класс: BioMap

Получите ссылочную последовательность из объекта BioMap

Синтаксис

Ref = getReference(BioObj)

Описание

Ref = getReference(BioObj) возвращает имя ссылочной последовательности от объекта BioMap. Это - свойство Reference объекта.

Входные параметры

BioObj

Объект BioRead или класса BioMap.

Выходные аргументы

Ref

Свойство Reference BioObj, объекта BioMap. Это - вектор символов или вектор строки определение имени ссылочной последовательности.

Примеры

Создайте объект BioMap, и затем получите ссылочную последовательность из объекта:

% Construct a BioMap object from a SAM file 
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Retrieve the reference sequence from the object
refSeq = getReference(BMObj1)
refSeq =

seq1

Альтернативы

Альтернатива использованию метода getReference должна использовать точечную индексацию со свойством Reference:

BioObj.Reference

Смотрите также

|

Темы

Внешние веб-сайты

Документация Bioinformatics Toolbox
Поддержка