Класс: BioMap
Вычислите положения остановки выровненных последовательностей чтения от объекта BioMap
Stop = getStop(BioObj)
Stop = getStop(BioObj, Subset)
Stop = getStop(BioObj)Stop, вектор целых чисел, задающих положение остановки выровненных последовательностей чтения относительно чисел положения в ссылочной последовательности от объекта BioMap.
Stop = getStop(BioObj, Subset)Subset.
|
Объект класса |
|
Одно из следующих, чтобы задать подмножество элементов в
ПримечаниеЕсли вы используете массив ячеек заголовков, чтобы задать |
|
Вектор целых чисел, задающих положение остановки выровненных последовательностей чтения относительно чисел положения в ссылочной последовательности. |
Создайте объект BioMap, и затем вычислите положение остановки для различных последовательностей в объекте:
% Construct a BioMap object from a SAM file
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Compute the stop position of the second sequence in the object
Stop_2 = getStop(BMObj1, 2)Stop_2 =
37% Compute the stop positions of the first and third sequences in % the object Stop_1_3 = getStop(BMObj1, [1 3])
Stop_1_3 =
36
39% Compute the stop positions of all sequences in the object Stop_All = getStop(BMObj1);