Класс: BioMap
Получите запускают положения выровненных последовательностей чтения от объекта BioMap
Start = getStart(BioObj)
Start = getStart(BioObj, Subset)
Start = getStart(BioObj)Start, вектор целых чисел, задающих положение запуска выровненных последовательностей чтения относительно чисел положения в ссылочной последовательности от объекта BioMap.
Start = getStart(BioObj, Subset)Subset.
|
Объект класса |
|
Одно из следующих, чтобы задать подмножество элементов в
ПримечаниеЕсли вы используете массив ячеек заголовков, чтобы задать |
|
Свойство |
Создайте объект BioMap, и затем получите положение запуска для различных последовательностей в объекте:
% Construct a BioMap object from a SAM file
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Retrieve the start property of the second element in the object
Start_2 = getStart(BMObj1, 2)Start_2 =
3% Retrieve the start properties of the first and third elements in % the object Start_1_3 = getStart(BMObj1, [1 3])
Start_1_3 =
1
5% Retrieve the start properties of all elements in the object Start_All = getStart(BMObj1);
Альтернатива использованию метода getStart должна использовать точечную индексацию со свойством Start:
BioObj.Start(Indices)
В предыдущем синтаксисе Indices является вектором положительных целых чисел или логическим вектором. Indices не может быть массивом ячеек из символьных векторов или представить в виде строки вектор, содержащий заголовки последовательности.