gprread
Считайте микроданные массива из Результатов GenePix (GPR) файл
Синтаксис
GPRData = gprread(File)
gprread(..., 'PropertyName', PropertyValue,...)
gprread(..., 'CleanColNames', CleanColNamesValue)
Аргументы
File | GenePix® Results (GPR) отформатировал файл. Введите вектор символов или строку, задающую имя файла, или путь и имя файла. |
CleanColNamesValue | Управляет созданием имен столбцов, которые могут использоваться в качестве имен переменных. |
Описание
GPRData = gprread(File)FileGPRData).
gprread(..., ' задает дополнительные свойства с помощью имени свойства / пары значения.PropertyName', PropertyValue,...)
gprread(..., 'CleanColNames', управляет созданием имен столбцов, которые могут использоваться в качестве имен переменных. Файл GPR может содержать имена столбцов с пробелами и некоторыми символами, которые программное обеспечение MATLAB не может использовать на имена переменной MATLAB. Если CleanColNamesValue)CleanColNamesValue является true, gprread возвращает имена в поле ColumnNames, которые являются допустимыми именами переменной MATLAB и именами, которые можно использовать в функциях. По умолчанию CleanColNamesValue является false, и поле ColumnNames может содержать символы, которые недопустимы для имен переменной MATLAB.
Поле Indices структуры содержит индексы, которые могут использоваться для графического вывода карт тепла данных.
Для получения дополнительной информации на формате GPR, смотрите
Функция поддерживает версии 3, 4 и 5 из Формата Результатов GenePix.
Примеры
Считайте и отобразите данные из результата GenePix® (GPR) файл
Этот пример показывает, как считать и отобразить данные из результата GenePix® (GPR) файл.
Читайте в демонстрационном файле GPR.
gprStruct = gprread('mouse_a1pd.gpr')gprStruct = struct with fields:
Header: [1x1 struct]
Data: [9504x38 double]
Blocks: [9504x1 double]
Columns: [9504x1 double]
Rows: [9504x1 double]
Names: {9504x1 cell}
IDs: {9504x1 cell}
ColumnNames: {38x1 cell}
Indices: [132x72 double]
Shape: [1x1 struct]
Постройте среднюю приоритетную интенсивность для канала на 635 нм.
maimage(gprStruct,'F635 Median')
Смотрите также
affyread | agferead | celintensityread | galread | geoseriesread | geosoftread | ilmnbsread | imageneread | magetfield | sptread