Exponenta Banner

gprread

Считайте микроданные массива из Результатов GenePix (GPR) файл

свернуть все на странице

Синтаксис

GPRData = gprread(File)
gprread(..., 'PropertyName', PropertyValue,...)
gprread(..., 'CleanColNames', CleanColNamesValue)

Аргументы

File

GenePix® Results (GPR) отформатировал файл. Введите вектор символов или строку, задающую имя файла, или путь и имя файла.

CleanColNamesValue

Управляет созданием имен столбцов, которые могут использоваться в качестве имен переменных.

Описание

GPRData = gprread(File) считывает данные о результатах GenePix из File и создает структуру MATLAB® (GPRData).

gprread(..., 'PropertyName', PropertyValue,...) задает дополнительные свойства с помощью имени свойства / пары значения.

gprread(..., 'CleanColNames', CleanColNamesValue) управляет созданием имен столбцов, которые могут использоваться в качестве имен переменных. Файл GPR может содержать имена столбцов с пробелами и некоторыми символами, которые программное обеспечение MATLAB не может использовать на имена переменной MATLAB. Если CleanColNamesValue является true, gprread возвращает имена в поле ColumnNames, которые являются допустимыми именами переменной MATLAB и именами, которые можно использовать в функциях. По умолчанию CleanColNamesValue является false, и поле ColumnNames может содержать символы, которые недопустимы для имен переменной MATLAB.

Поле Indices структуры содержит индексы, которые могут использоваться для графического вывода карт тепла данных.

Для получения дополнительной информации на формате GPR, смотрите

https://mdc.custhelp.com/app/answers/detail/a_id/18883/kw/file%20format

Функция поддерживает версии 3, 4 и 5 из Формата Результатов GenePix.

Примеры

свернуть все

Скрипт Open Live Script

Этот пример показывает, как считать и отобразить данные из результата GenePix® (GPR) файл.

Читайте в демонстрационном файле GPR.

gprStruct = gprread('mouse_a1pd.gpr')
gprStruct = struct with fields:
         Header: [1x1 struct]
           Data: [9504x38 double]
         Blocks: [9504x1 double]
        Columns: [9504x1 double]
           Rows: [9504x1 double]
          Names: {9504x1 cell}
            IDs: {9504x1 cell}
    ColumnNames: {38x1 cell}
        Indices: [132x72 double]
          Shape: [1x1 struct]

Постройте среднюю приоритетную интенсивность для канала на 635 нм.

maimage(gprStruct,'F635 Median')

Смотрите также

| | | | | | | | |

Представлено до R2006a

Документация Bioinformatics Toolbox
Поддержка