Exponenta Banner

getTranscriptNames

Класс: GTFAnnotation

Получите уникальные имена расшифровки стенограммы из объекта GTFAnnotation

Синтаксис

Transcripts = getTranscriptNames(AnnotObj)

Описание

Transcripts = getTranscriptNames(AnnotObj) возвращает Transcripts, массив ячеек из символьных векторов, задающий уникальные имена расшифровки стенограммы, сопоставленные с аннотациями в AnnotObj.

Входные параметры

AnnotObj

Объект класса GTFAnnotation.

Выходные аргументы

Transcripts

Массив ячеек из символьных векторов, задающий уникальные имена расшифровки стенограммы, сопоставлен с аннотациями в AnnotObj.

Примеры

Создайте объект GTFAnnotation из отформатированного GTF файла, которому предоставляют Bioinformatics Toolbox™, и затем получите список уникальных имен расшифровки стенограммы от объекта:

% Construct a GTFAnnotation object from a GTF file
GTFAnnotObj = GTFAnnotation('hum37_2_1M.gtf');
% Get transcript names from object
transcriptNames = getTranscriptNames(GTFAnnotObj)
transcriptNames = 

    'uc002qvu.2'
    'uc002qvv.2'
    'uc002qvw.2'
    'uc002qvx.2'
    'uc002qvy.2'
    'uc002qvz.2'
    'uc002qwa.2'
    'uc002qwb.2'
    'uc002qwc.1'
    'uc002qwd.2'
    'uc002qwe.3'
    'uc002qwf.2'
    'uc002qwg.2'
    'uc002qwh.2'
    'uc002qwi.3'
    'uc002qwk.2'
    'uc002qwl.2'
    'uc002qwm.1'
    'uc002qwn.1'
    'uc002qwo.1'
    'uc002qwp.2'
    'uc002qwq.2'
    'uc010ewe.2'
    'uc010ewf.1'
    'uc010ewg.2'
    'uc010ewh.1'
    'uc010ewi.2'
    'uc010yim.1'

Смотрите также

Темы

Внешние веб-сайты

Документация Bioinformatics Toolbox
Поддержка