Класс: GTFAnnotation
Получите имена уникальной функции из GTFAnnotation
объект
Features = getFeatureNames(AnnotObj)
возвращает Features
= getFeatureNames(AnnotObj
)Features
, массив ячеек из символьных векторов, задающий имена уникальной функции, сопоставлен с аннотациями в AnnotObj
.
|
Объект |
|
Массив ячеек из символьных векторов, задающий имена уникальной функции, сопоставлен с аннотациями в |
Создайте GTFAnnotation
объект из отформатированного GTF файла, которому предоставляют Bioinformatics Toolbox™, и затем получает имена функции из объекта аннотации:
% Construct a GTFAnnotation object from a GTF file GTFAnnotObj = GTFAnnotation('hum37_2_1M.gtf'); % Retrieve feature names for the annotation object featureNames = getFeatureNames(GTFAnnotObj)
featureNames = 'CDS' 'exon' 'start_codon' 'stop_codon'
GFFAnnotation
| GTFAnnotation
| getData (GTFAnnotation)
| getFeatureNames (GTFAnnotation)
| getGeneNames (GTFAnnotation)
| getGenes (GTFAnnotation)
| getIndex (GTFAnnotation)
| getRange (GTFAnnotation)
| getReferenceNames (GTFAnnotation)
| getSegments (GTFAnnotation)
| getSubset (GTFAnnotation)
| getTranscripts (GTFAnnotation)