Класс: GTFAnnotation
Получите ссылочные имена из GTFAnnotation объект
References = getReferenceNames(AnnotObj)
References = getReferenceNames(AnnotObj)References, массив ячеек из символьных векторов, задающий имена всех ссылочных последовательностей в AnnotObj.
|
Объект |
|
Массив ячеек из символьных векторов, задающий имена всех ссылочных последовательностей в |
Создайте GTFAnnotation объект из отформатированного GTF файла, которому предоставляют Bioinformatics Toolbox™, и затем возвращает имена ссылочных последовательностей от объекта аннотации:
% Construct a GTFAnnotation object from a GTF file
GTFAnnotObj = GTFAnnotation('hum37_2_1M.gtf');
% Return reference names for the annotation object
refNames = getReferenceNames(GTFAnnotObj)
refNames =
'chr2'
GFFAnnotation | GTFAnnotation | getData (GTFAnnotation) | getFeatureNames (GTFAnnotation) | getGeneNames (GTFAnnotation) | getGenes (GTFAnnotation) | getIndex (GTFAnnotation) | getRange (GTFAnnotation) | getReferenceNames (GTFAnnotation) | getSegments (GTFAnnotation) | getSubset (GTFAnnotation) | getTranscripts (GTFAnnotation)