DataMatrix object

Структура информации, описывающей данные и метаданные, полученные от экспериментов с микромассивом, таким образом, что она может быть проиндексирована относительно генных идентификаторов, идентификаторов проб и образцов

Описание

Объект DataMatrix является структурой данных, инкапсулирующей данные об измерении и метаданные функции из эксперимента микромассивов так, чтобы это могло быть индексировано геном или тестовыми идентификаторами и демонстрационными идентификаторами. DataMatrix экспериментальные данные объектно-ориентированной памяти в матрице, со строками, обычно соответствующими названиям генов или тестовым идентификаторам и столбцам, обычно соответствующим демонстрационным идентификаторам. Объект DataMatrix также хранит метаданные, такие как названия генов или тестовые идентификаторы и демонстрационные идентификаторы, на имена строки и имена столбцов.

Вы создаете объект DataMatrix с помощью функции конструктора Object DataMatrix.

Сводные данные свойства

Свойства объекта DataMatrix

Свойство	Описание
`Name`	Вектор символов, который описывает объект DataMatrix. Значением по умолчанию является `''`.
`RowNames`	Пустой массив или массив ячеек из символьных векторов, который задает имена для строк, обычно названий генов или тестовых идентификаторов. Число элементов в массиве ячеек должно равняться количеству строк в матрице. Значением по умолчанию является пустой массив.
`ColNames`	Пустой массив или массив ячеек из символьных векторов, который задает имена для столбцов, обычно демонстрационных идентификаторов. Число элементов в массиве ячеек должно равняться количеству столбцов в матрице.
`NRows`	Только для чтения. Положительное число, которое задает количество строк в матрице. Примечание Вы не можете изменить это свойство непосредственно. Можно получить доступ к нему с помощью `get` метод.
`NCols`	Только для чтения. Положительное число, которое задает количество столбцов в матрице. Примечание Вы не можете изменить это свойство непосредственно. Можно получить доступ к нему с помощью `get` метод.
`NDims`	Только для чтения. Положительное число, которое задает количество размерностей в матрице. Примечание Вы не можете изменить это свойство непосредственно. Можно получить доступ к нему с помощью `get` метод.
`ElementClass`	Только для чтения. Вектор символов, который задает тип класса элементов в объекте DataMatrix, таких как `single` или `double`. Примечание Вы не можете изменить это свойство непосредственно. Можно получить доступ к нему с помощью `get` метод.

Сводные данные метода

Общие методы объекта DataMatrix

Метод	Описание
`colnames`	Получите или установите имена столбцов объекта DataMatrix.
`disp`	Объект Display DataMatrix.
`display`	Отобразите объект DataMatrix, распечатав имя объекта DataMatrix. Чтобы вызвать этот метод, введите имя объекта DataMatrix в командной строке.
`dmwrite`	Запишите объект DataMatrix в текстовый файл.
`double`	Преобразуйте объект DataMatrix в массив с двойной точностью.
`get`	Получите информацию об объекте DataMatrix.
`isempty`	Определите, пуст ли объект DataMatrix.
`isfinite`	Определите, конечны ли элементы объекта DataMatrix.
`isinf`	Определите, бесконечны ли элементы объекта DataMatrix.
`isnan`	Определите, является ли элементами объекта DataMatrix NaN.
`isscalar`	Определите, является ли объект DataMatrix скаляром.
`isequal`	Протестируйте объекты DataMatrix на равенство.
`isequaln`	Протестируйте объекты DataMatrix на равенство, обработав NaNs как равный.
`isvector`	Определите, является ли объект DataMatrix вектором.
`length`	Возвратите длину объекта DataMatrix.
`ndims`	Возвратите количество размерностей в объекте DataMatrix.
`numel`	Возвратите число элементов в объекте DataMatrix.
`plot`	Чертите 2D график объекта DataMatrix.
`rownames`	Получите или определите имена строки объекта DataMatrix.
`set`	Установите свойство объекта DataMatrix.
`single`	Преобразуйте объект DataMatrix в массив с одинарной точностью.
`size`	Возвратите размер объекта DataMatrix.

Методы для управления данными в объекте DataMatrix

Метод	Описание
`cat`	Конкатенация объектов DataMatrix. `horzcat` и `vertcat` методы реализуют особые случаи.
`horzcat`	Конкатенация DataMatrix возражает горизонтально.
`sortcols`	Сортировка столбцов объекта DataMatrix в порядке возрастания или убывания.
`sortrows`	Сортировка строк объекта DataMatrix в порядке возрастания или убывания.
`subsasgn`	Преобразованное в нижний индекс присвоение для объекта DataMatrix. Чтобы вызвать этот метод, используйте круглые скобки или индексацию точки, описанную в Доступе к Данным в Объектах DataMatrix.
`subsref`	Преобразованная в нижний индекс ссылка для объекта DataMatrix. Чтобы вызвать этот метод, используйте круглые скобки или индексацию точки, описанную в Доступе к Данным в Объектах DataMatrix.
`transpose`	Объект Transpose DataMatrix.
`vertcat`	Конкатенация DataMatrix возражает вертикально.

Описательная статистика и статистическое изучение методов

Метод	Описание
`kmeans`	Кластеризация k-средних значений.
`max`	Возвратите максимальные значения в объекте DataMatrix.
`mean`	Возвратите средние или средние значения в объекте DataMatrix.
`median`	Возвратите средние значения в объекте DataMatrix.
`min`	Возвратите минимальные значения в объекте DataMatrix.
`nanmax`	Возвратите максимальные значения в значениях NaN игнорирования объекта DataMatrix.
`nanmean`	Возвратите средние или средние значения в значениях NaN игнорирования объекта DataMatrix.
`nanmedian`	Возвратите средние значения в значениях NaN игнорирования объекта DataMatrix.
`nanmin`	Возвратите минимальные значения в значениях NaN игнорирования объекта DataMatrix.
`nanstd`	Возвратите значения стандартного отклонения в значениях NaN игнорирования объекта DataMatrix.
`nansum`	Возвратите сумму элементов в значениях NaN игнорирования объекта DataMatrix.
`nanvar`	Возвратите значения отклонения в значениях NaN игнорирования объекта DataMatrix.
`pca`	Анализ главных компонентов данных.
`pdist`	Попарное расстояние.
`std`	Возвратите значения стандартного отклонения в объекте DataMatrix.
`sum`	Возвратите сумму элементов в объекте DataMatrix.
`var`	Возвратите значения отклонения в объекте DataMatrix.

Унарные методы — экспоненциал

Метод	Описание
`exp`	Экспоненциал.
`log`	Натуральный логарифм.
`log10`	Распространенный (базируются 10), логарифм.
`log2`	Основывайте 2 логарифма и разделите числа с плавающей запятой в экспоненту и мантиссу.
`pow2`	Основывайте 2 степени и числа с плавающей запятой шкалы.
`sqrt`	Квадратный корень.

Унарные методы — целое число

Метод	Описание
`ceil`	Круглый объект DataMatrix к бесконечности.
`fix`	Круглый объект DataMatrix к нулю.
`floor`	Круглый объект DataMatrix к минус бесконечность.
`round`	Круглый объект DataMatrix к самому близкому целому числу.

Унарные методы — пользовательский

Метод	Описание
`dmarrayfun`	Примените функцию к каждому элементу в объекте DataMatrix.

Двоичные методы — арифметический оператор

Оператор	Метод	Описание
`+`	`plus`	Добавьте объекты DataMatrix
`-`	`minus`	Вычтите объекты DataMatrix.
`.*`	`times`	Умножьте объекты DataMatrix.
`./`	`rdivide`	Правый массив делит объекты DataMatrix.
`.\`	`ldivide`	Левый массив делит объекты DataMatrix.
`.^`	`power`	Степень массивов объекты DataMatrix.

Двоичные методы — оператор отношения

Оператор	Метод	Описание
`<`	`lt`	Протестируйте объекты DataMatrix на меньше, чем.
`<=`	`le`	Протестируйте объекты DataMatrix на меньше чем или равный.
`>`	`gt`	Протестируйте объекты DataMatrix на больший, чем.
`>=`	`ge`	Протестируйте объекты DataMatrix на больший, чем или равный.
`==`	`eq`	Протестируйте объекты DataMatrix на равенство.
`~=`	`ne`	Протестируйте объекты DataMatrix на неравенство.

Двоичные методы — пользовательский

Метод	Описание
`dmbsxfun`	Примените поэлементно бинарную операцию к двум объектам DataMatrix с одноэлементным включенным расширением.

Примеры

Пример 10. Определение свойств и значений свойств объекта DataMatrix

Можно отобразить все свойства и их текущие значения объекта DataMatrix, DMobj, при помощи следующего синтаксиса:

get(DMobj)

Можно возвратить все свойства и их текущие значения DMobj, объект DataMatrix, к DMstruct, скалярная структура, в которой каждое имя поля является свойством объекта DataMatrix и каждым полем, содержит значение того свойства, при помощи следующего синтаксиса:

DMstruct = get(DMobj)

Можно возвратить значение определенного свойства объекта DataMatrix, DMobj, при помощи любого из следующих синтаксисов:

PropertyValue = get(DMObj, 'PropertyName')

PropertyValue = DMObj.PropertyName

Можно возвратить значение определенных свойств объекта DataMatrix, DMobj, при помощи следующего синтаксиса:

[Property1Value, Property2Value, ...] = get(DMobj, ...
'Property1Name', 'Property2Name', ...)

Пример 11. Определение возможных значений свойств объектов DataMatrix

Можно отобразить возможные значения для всех свойств, которые имеют фиксированный набор значений свойств в объекте DataMatrix, DMobj, при помощи следующего синтаксиса:

set(DMobj)

Можно отобразить возможные значения для определенного свойства, которое имеет фиксированный набор значений свойств в объекте DataMatrix, DMobj, при помощи следующего синтаксиса:

set(DMObj,  'PropertyName')

Пример 12. Определение свойств объекта DataMatrix

Можно установить определенное свойство объекта DataMatrix, DMObj, при помощи любого из следующих синтаксисов:

DMObj = set(DMObj,  'PropertyName', PropertyValue)

DMObj.PropertyName = PropertyValue

Можно установить несколько свойств объекта DataMatrix, DMobj, при помощи следующего синтаксиса:

set(DMobj,  'PropertyName1', PropertyValue1, ...
    'PropertyName2', PropertyValue2, ...)

Примечание

Для большего количества примеров создания и использования объектов DataMatrix, смотрите Значения данных Выражения Представления в Объектах DataMatrix.

Вопросы совместимости

развернуть все

`princomp` метод был переименован

Ошибки, запускающиеся в R2017b

princomp метод DataMatrix object был переименован. Замените экземпляры princomp с pca.

Документация

DataMatrix object

Описание

Сводные данные свойства

Примечание

Примечание

Примечание

Примечание

Сводные данные метода

Примеры

Примечание

Вопросы совместимости

`princomp` метод был переименован

Смотрите также

Представленный в R2008b

Документация Bioinformatics Toolbox

Поддержка

Документация

DataMatrix object

Описание

Сводные данные свойства

Примечание

Примечание

Примечание

Примечание

Сводные данные метода

Примеры

Примечание

Вопросы совместимости

princomp метод был переименован

Смотрите также

Представленный в R2008b

Документация Bioinformatics Toolbox

Поддержка

`princomp` метод был переименован