Импорт данных и управление

Импортируйте данные и аннотации от Affymetrix® GeneChip®, Illumina®, Agilent®, Gene Expression Omnibus (GEO), ImaGene®, SPOT, GenePix® GPR и GAL; управляйте экспериментальными данными и демонстрационными метаданными на стандарт MIAME

Функции

affyreadСчитайте данные микромассивов из файла Affymetrix GeneChip
affysnpannotreadДанные массива ДНК Рида Аффиметрикса Мэппинга из файла аннотации формата CSV
affyprobeseqreadСчитайте файл данных, содержащий тестовую информацию о последовательности для массива Affymetrix GeneChip
celintensityreadСчитайте тестовую интенсивность из файлов Affymetrix CEL
getgeodataПолучите данные о формате Gene Expression Omnibus (GEO)
geoseriesreadСчитайте Ряд Gene Expression Omnibus (GEO) (GSE) данные о формате
geosoftreadСчитайте данные Gene Expression Omnibus (GEO) в формате SOFT
galreadСчитайте микроданные массива из файла списка массива GenePix
gprreadСчитайте микроданные массива из Результатов GenePix (GPR) файл
agfereadПрограммный файл Извлечения признаков Рида Аджилента
ilmnbsreadСчитайте данные об экспрессии гена, экспортированные из программного обеспечения Illumina BeadStudio
imagenereadСчитайте микроданные массива из файла Результатов ImaGene
sptreadСчитайте данные из файла SPOT
goannotreadСчитайте аннотации из аннотированного файла Gene Ontology
cytobandreadСчитайте цитогенетические информации соединения

Классы

bioma.ExpressionSetСодержите данные из эксперимента экспрессии гена микромассивов
bioma.data.ExptDataСодержите значения данных из эксперимента микромассивов
bioma.data.MetaDataСодержите метаданные из эксперимента микромассивов
bioma.data.MIAMEСодержите информацию об эксперименте из эксперимента экспрессии гена микромассивов

Темы

Данные об экспрессии гена управления в объектах

Обзор объектов для Данных об Экспрессии гена Микромассивов

Представление значений данных выражения в объектах DataMatrix

Создайте объекты DataMatrix, получите и установите свойства и данные о доступе.

Представление значений данных выражения в объектах ExptData

Создайте объекты ExptData, используйте свойства и методы и данные о доступе.

Представление метаданных выборки и функции в объектах MetaData

Создайте объекты MetaData, используйте свойства и методы и данные о доступе.

Представление информации об эксперименте в объекте MIAME

Создайте объекты MIAME, используйте свойства и методы и данные о доступе.

Представление всех данных в объекте ExpressionSet

Создайте объекты ExpressionSet, используйте свойства и методы и данные о доступе.

Визуализация изображений микромассивов

Создайте фигуры, чтобы визуализировать микроданные массива и подготовить данные к анализу.

Exchange Bioinformatics Data Between Excel и MATLAB

Пример использования Spreadsheet Link™ с программным обеспечением, чтобы просмотреть биоинформатические данные

Устройство хранения данных микроданных массива

Bioinformatics Toolbox™ включает функции, объекты и методы для создания, хранения и доступа к микроданным массива.

Форматы данных и базы данных

Доступ к онлайновым базам данных и репозиториям с помощью различных функций MATLAB® и импортирует данные к рабочей области для последующих анализов.

Рекомендуемые примеры

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте