gprread
Считайте микроданные массива из Результатов GenePix (GPR) файл
Синтаксис
GPRData = gprread(File)
gprread(..., 'PropertyName', PropertyValue,...)
gprread(..., 'CleanColNames', CleanColNamesValue)
Аргументы
File | GenePix® Results (GPR) отформатировал файл. Введите вектор символов или строку, задающую имя файла, или путь и имя файла. |
CleanColNamesValue | Управляет созданием имен столбцов, которые могут использоваться в качестве имен переменных. |
Описание
GPRData = gprread(File)FileGPRData).
gprread(..., ' задает дополнительные свойства с помощью имени свойства / пары значения.PropertyName', PropertyValue,...)
gprread(..., 'CleanColNames', управляет созданием имен столбцов, которые могут использоваться в качестве имен переменных. Файл GPR может содержать имена столбцов с пробелами и некоторыми символами, которые программное обеспечение MATLAB не может использовать на имена переменной MATLAB. Если CleanColNamesValue)CleanColNamesValue true, gprread возвращает имена в поле ColumnNames это - допустимые имена переменной MATLAB и имена, которые можно использовать в функциях. По умолчанию, CleanColNamesValue false и поле ColumnNames может содержать символы, которые недопустимы для имен переменной MATLAB.
Поле Indices из структуры содержит индексы, которые могут использоваться в графическом выводе карт тепла данных.
Для получения дополнительной информации о формате GPR смотрите
Функция поддерживает версии 3, 4 и 5 из Формата Результатов GenePix.
Примеры
Считайте и отобразите данные из результата GenePix® (GPR) файл
В этом примере показано, как считать и отобразить данные из результата GenePix® (GPR) файл.
Читайте в демонстрационном файле GPR.
gprStruct = gprread('mouse_a1pd.gpr')gprStruct = struct with fields:
Header: [1x1 struct]
Data: [9504x38 double]
Blocks: [9504x1 double]
Columns: [9504x1 double]
Rows: [9504x1 double]
Names: {9504x1 cell}
IDs: {9504x1 cell}
ColumnNames: {38x1 cell}
Indices: [132x72 double]
Shape: [1x1 struct]
Постройте среднюю приоритетную интенсивность для канала на 635 нм.
maimage(gprStruct,'F635 Median')
Смотрите также
affyread | agferead | celintensityread | galread | geoseriesread | geosoftread | ilmnbsread | imageneread | magetfield | sptread