Класс: BioMap
Получите подпись (информация о выравнивании) от BioMap
объект
Signature
= getSignature(BioObj
)
Signature
= getSignature(BioObj
, Subset
)
возвращает Signature
= getSignature(BioObj
)Signature
, массив ячеек отформатированных строк СИГАРЫ, каждое представление, как последовательность чтения в a BioMap
объект выравнивается к ссылочной последовательности.
возвращает строки подписи только для объектных элементовSignature
= getSignature(BioObj
, Subset
), указанных Subset
.
|
Объект |
|
Одно из следующих, чтобы задать подмножество элементов в
Примечание Если вы используете массив ячеек заголовков, чтобы задать |
|
|
Создайте a BioMap
объект, и затем получает подписи для различных элементов в объекте:
% Construct a BioMap object from a SAM file BMObj1 = BioMap('ex1.sam'); % Retrieve the signature property of the second element in % the object Sig_2 = getSignature(BMObj1, 2)
Sig_2 = '35M'
% Retrieve the signature properties of the first and third % elements in the object Sig_1_3 = getSignature(BMObj1, [1 3])
Sig_1_3 = '36M' '35M'
% Retrieve the signature properties of all elements in the object Sig_All = getSignature(BMObj1);
Альтернатива использованию getSignature
метод должен использовать точечную индексацию с Signature
свойство:
BioObj.Sgnature(Indices)
В предыдущем синтаксисе, Indices
вектор из положительных целых чисел или логический вектор. Indices
не может быть массив ячеек из символьных векторов или представить в виде строки вектор, содержащий заголовки последовательности.