Возвратить матрицу оценок BLOSUM
Matrix
= blosum(Identity
)
[Matrix
, MatrixInfo
]
= blosum(Identity
)
... = blosum(Identity
,
...'Extended', ExtendedValue
, ...)
... = blosum(Identity
,
...'Order', OrderValue
, ...)
Identity | Скаляр, задающий единичный уровень процента. Выбор:
|
ExtendedValue | Управляет списком расширенных кодов аминокислоты. Выбором является true (значение по умолчанию) или false . |
OrderValue | Вектор символов или строка, содержащая легальные символы аминокислоты, который задает аминокислоты порядка, перечислены в матрице. Длиной вектора символов или строки должен быть 20 или 24 . |
Matrix | BLOSUM (Матрица Замены Блоков) выигрыш матрицы с заданной идентичностью процента. |
MatrixInfo | Структура информации о
|
возвращает BLOSUM (Матрица Замены Блоков) выигрыш матрицы с заданной идентичностью процента. Упорядоченное расположение по умолчанию выхода включает расширенные символы Matrix
= blosum(Identity
)B
Z
X
, и *
.
A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X *
[
возвращает Matrix
, MatrixInfo
]
= blosum(Identity
)MatrixInfo
, структура информации о Matrix
, матрица BLOSUM. MatrixInfo
содержит следующие поля:
Name
Scale
Entropy
ExpectedScore
HighestScore
LowestScore
Order
... = blosum (
вызовы Identity
PropertyName
', PropertyValue
, ...)blosum
с дополнительными свойствами, которые используют имя свойства / пары значения свойства. Можно задать одно или несколько свойств в любом порядке. Каждый PropertyName
должен быть заключен в одинарные кавычки и нечувствительный к регистру. Это имя свойства / пары значения свойства следующие:
... = blosum(
управляет списком расширенных кодов аминокислоты. Выбором является Identity
,
...'Extended', ExtendedValue
, ...)true
(значение по умолчанию) или false
. Если ExtendedValue
false
, возвращает матрицу выигрыша для стандартного 20
аминокислоты. Упорядоченное расположение выхода, когда ExtendedValue
false
A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V
... = blosum(
возвращает матрицу BLOSUM, упорядоченнуюIdentity
,
...'Order', OrderValue
, ...) OrderValue
, вектор символов или строка, содержащая легальные символы аминокислоты, который задает аминокислоты порядка, перечислены в матрице. Длиной вектора символов или строки должен быть 20
или 24
.