nuc44

Возвратите матрицу оценок NUC44 для последовательностей нуклеотида

Синтаксис

ScoringMatrix = nuc44
[ScoringMatrix, MatrixInfo] = nuc44

Описание

ScoringMatrix = nuc44 возвращает матрицу выигрыша. nuc44 выигрыш матрицы использует неоднозначные коды нуклеотида и вероятности, округленные до ближайшего целого числа.

Масштабируйтесь = 0.277316

Ожидаемый счет = -1.7495024, Энтропия = 0.5164710 биты

Самый низкий счет = -4, Самый высокий счет = 5

Порядок: A C G T R Y K M S W B D H V N

[ScoringMatrix, MatrixInfo] = nuc44 возвращает структуру с информацией о матрице с полями Name и Order.

Примечание

Матрица выигрыша NUC44 предоставляется NCBI и используется набором BLAST программ. Для получения дополнительной информации смотрите ftp://ftp.ncbi.nih.gov/blast/matrices/.

Смотрите также

| | | | | |

Представлено до R2006a
Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте