Считайте данные из файла EMBL
EMBLData
= emblread(File
)
EMBLSeq
= emblread (File
,
'SequenceOnly', SequenceOnlyValue
)
EMBLSeq
= emblread (File
,
'TimeOut', TimeOutValue
)
File | Любое из следующего:
Совет Можно использовать |
SequenceOnlyValue | Управляет чтением только последовательности без метаданных. Выбором является true или false (значение по умолчанию). |
TimeOutValue | Тайм-аут связи в секундах в виде положительной скалярной величины. Значение по умолчанию равняется 5. Для получения дополнительной информации смотрите здесь. |
EMBLData | Структура с полями, соответствующими данным EMBL. |
EMBLSeq | Вектор символов, представляющий последовательность. |
считывает данные из EMBLData
= emblread(File
)File
, EMBL-отформатированный файл, и создает EMBLData
, структура MATLAB, содержащая поля, соответствующие 2D символьной линии EMBL, вводит код, на основе релиза 107 формата плоского файла EMBL-Bank. Каждый код типа линии хранится как отдельный элемент в структуре. Для списка 2D символьных кодов типа линии EMBL см. ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/embl/doc/usrman.txt.
Примечание
Информация о топологии не была включена в плоские файлы EMBL перед релизом 87 базы данных. При чтении файла, созданного перед релизом 87, EMBLREAD возвращает пустой Identification.Topology
поле .
Примечание
Имя записи больше не отображается в линии ID плоских файлов EMBL в релизе 87. При чтении файла, созданного в релизе 87, EMBLREAD возвращает инвентарный номер в Identification.EntryName
поле .
управляет чтением только последовательности без метаданных. Выбором является EMBLSeq
= emblread (File
,
'SequenceOnly', SequenceOnlyValue
)true
или false
(значение по умолчанию).
устанавливает тайм-аут связи (в секундах) считывать данные из удаленного файла или URL.EMBLSeq
= emblread (File
,
'TimeOut', TimeOutValue
)
fastaread
| genbankread
| genpeptread
| getembl
| pdbread
| seqviewer