Получите информацию о филогенетическом древовидном объекте
[
Value1, Value2,...
] =
get(Tree, 'Property1','Property2',...
)
get(Tree
)
V
= get(Tree
)
Tree | Объект Phytree создается с функцией phytree . |
Name | Имя свойства phytree объект. |
[
возвращает заданные свойства в объект phytree (Value1, Value2,...
] =
get(Tree, 'Property1','Property2',...
)Tree
).
Свойства для phytree
объект перечислен в следующей таблице.
Свойство | Описание |
---|---|
NumLeaves | Количество листов |
NumBranches | Количество ветвей |
NumNodes | Количество узлов (NumLeaves + NumBranches ) |
Pointers | Перейдите к списку возможностей соединения листа/ветви |
Distances | Длина ребра для каждого листа/ветви |
LeafNames | Имена листов |
BranchNames | Имена ветвей |
NodeNames | Имена всех узлов |
get(
отображения все имена свойства и их текущие значения для объекта phytree (Tree
)Tree
).
возвращает структуру, где каждое имя поля является именем свойства объекта phytree (V
= get(Tree
)Tree
) и каждое поле содержит значение того свойства.
Читайте в филогенетическом дереве из файла.
tr = phytreeread('pf00002.tree') Phylogenetic tree object with 33 leaves (32 branches)
Получите имена листов.
protein_names = get(tr,'LeafNames') protein_names = 'Q9YHC6_RANRI/126-382' 'VIPR1_RAT/140-397' 'VIPR_CARAU/100-359' ...