ngsbrowser

(Удаленный) Открытый NGS Browser, чтобы визуализировать и исследовать выравнивания

ngsbrowser был удален. Используйте Genomics Viewer вместо этого.

Синтаксис

Описание

ngsbrowser открывает приложение NGS Browser.

ngsbrowser(bmObj) импортирует объект BioMap bmObj и открывает его в приложении NGS Browser.

Входные параметры

свернуть все

Объект, содержащий информацию о последовательности или данные о выравнивании последовательности короткого чтения в виде BioMap объект.

Примеры

свернуть все

Создайте объект BioMap из SAM-отформатированного файла.

b = BioMap('ex1.sam');

Отобразите объект в NGS Browser.

ngsbrowser(b)

Советы

  • Используйте NGS Browser, чтобы сравнить выравнивание нескольких наборов данных к последовательности общей ссылки.

  • Используйте NGS Browser, чтобы исследовать необходимые области в выравнивании короткого чтения, определенном различными исследованиями, такими как RNA-Seq, ЧИП-Seq и исследования наследственной изменчивости.

Вопросы совместимости

развернуть все

Ошибки, запускающиеся в R2021a

Представленный в R2011b
Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте