probesetlink

Отобразите тестовую информацию о наборе на веб-сайте NetAffx

Синтаксис

probesetlink(AffyStruct, PS)
URL = probesetlink(AffyStruct, PS)
probesetlink(AffyStruct, PS, ...'Source', SourceValue, ...)
probesetlink(AffyStruct, PS, ...'Browser', BrowserValue, ...)
URL = probesetlink(AffyStruct, PS, ...'NoDisplay', NoDisplayValue, ...)

Входные параметры

AffyStruct Структура, созданная affyread функция из файла Affymetrix® CHP или файла библиотеки Affymetrix CDF.
PSТестовый индекс набора или тестовый ID/имя набора.
SourceValueУправляет соединением с источником данных (например, GenBank® или Flybase) для тестового набора (вместо того, чтобы соединиться с веб-сайтом NetAffx™). Выбором является true или false (значение по умолчанию).

Примечание

Это свойство требует, чтобы файл библиотеки GIN, сопоставленный с CHP или CDF-файлом, был расположен в той же папке как файл библиотеки CDF.

BrowserValueУправляет отображением тестовой информации о наборе в веб-браузере вашей системы по умолчанию. Выбором является true или false (значение по умолчанию).
NoDisplayValueУправляет возвратом URL не открывая веб-браузер. Выбором является true или false (значение по умолчанию).

Выходные аргументы

URLURL для тестовой информации о наборе.

Описание

probesetlink(AffyStruct, PS) открывает информацию об отображении окна веб-браузера на веб-сайте NetAffx о тестовом наборе, заданном PS, тестовый индекс набора или тестовый ID/имя набора и AffyStruct, структура создается из файла CHP Affymetrix или файла библиотеки Affymetrix CDF.

URL = probesetlink(AffyStruct, PS) также возвращает URL (соединение с веб-сайтом NetAffx) для тестовой информации о наборе.

probesetlink (AffyStruct, PSPropertyName ', PropertyValue, ...) вызовы probesetlink с дополнительными свойствами, которые используют имя свойства / пары значения свойства. Можно задать одно или несколько свойств в любом порядке. Каждый PropertyName должен быть заключен в одинарные кавычки и нечувствительный к регистру. Это имя свойства / пары значения свойства следующие:

probesetlink(AffyStruct, PS, ...'Source', SourceValue, ...) управляет соединением с источником данных (например, GenBank или Flybase) для тестового набора (вместо того, чтобы соединиться с веб-сайтом NetAffx). Выбором является true или false (значение по умолчанию).

Примечание

'Source' свойство требует, чтобы файл библиотеки GIN, сопоставленный с CHP или CDF-файлом, был расположен в той же папке как файл библиотеки CDF.

probesetlink(AffyStruct, PS, ...'Browser', BrowserValue, ...) управляет отображением тестовой информации о наборе в веб-браузере вашей системы по умолчанию. Выбором является true или false (значение по умолчанию).

URL = probesetlink(AffyStruct, PS, ...'NoDisplay', NoDisplayValue, ...) управляет возвратом URL, не открывая веб-браузер. Выбором является true или false (значение по умолчанию).

Примечание

Веб-сайт NetAffx требует, чтобы вы указали и обеспечили имя пользователя и пароль.

Примеры

свернуть все

Этот пример использует выборочные данные от E. coli Массив Генома Антисмысла. Загрузите данные из Demo_Data_E-coli-antisense.zip. Извлеките файлы данных из архива DTT использование Инструмента Передачи данных.

Также необходимо загрузить Ecoli_ASv2. CDF и Ecoli-antisense-121502. Файлы CHP для E. coli Массив Генома Антисмысла. У вас могут уже быть эти файлы, если у вас есть какое-либо программное обеспечение Affymetrix GeneChip, установленное на вашей машине. В противном случае получите файлы библиотеки путем загрузки и разархивации E. coli zip-файл Генома Антисмысла Массивов.

Считайте содержимое файла CHP в структуру MATLAB, приняв, что соответствующий CDF-файл хранится в C:\LibFiles.

chpStruct = affyread('Ecoli-antisense-121502.CHP','C:\LibFiles');

Отобразите информацию с веб-сайта NetAffx о argG_b3172_at тестовый набор.

probesetlink(chpStruct,'argG_b3172_at')
Представлено до R2006a
Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте