Постройте зонд Affymetrix установленные значения интенсивности
probesetplot(
CELStruct
, CDFStruct
, PS
)
probesetplot(CELStruct
, CDFStruct
, PS
,
...'GeneName', GeneNameValue
, ...)
probesetplot(CELStruct
, CDFStruct
, PS
,
...'Field', FieldValue
, ...)
probesetplot(CELStruct
, CDFStruct
, PS
,
...'ShowStats', ShowStatsValue
, ...)
CELStruct | Структура, созданная affyread функция из файла Affymetrix® CEL. |
CDFStruct | Структура, созданная affyread функция из файла библиотеки Affymetrix CDF сопоставлена с файлом CEL. |
PS | Тестовый индекс набора или тестовый ID/имя набора. |
GeneNameValue | Средства управления, определил ли зонд имя или название гена, используются для заголовка графика. Выбором является true или false (значение по умолчанию).Примечание
|
FieldValue | Вектор символов или строка, задающая тип данных, чтобы построить. Выбор:
|
ShowStatsValue | Средства управления, включены ли линии среднего и стандартного отклонения в график. Выбором является true или false (значение по умолчанию). |
probesetplot(
премьер-министр графиков (идеальная пара) и MM (несоответствие) значения интенсивности для заданного тестового набора. CELStruct
, CDFStruct
, PS
)CELStruct
структура, созданная affyread
функция из файла Affymetrix CEL. CDFStruct
структура, созданная affyread
функция из файла библиотеки Affymetrix CDF сопоставлена с файлом CEL. PS
тестовый индекс набора или тестовый ID/имя набора.
Примечание
MATLAB использует 1
- основанная индексация для зонда определила номера, в то время как CDF-файл Affymetrix использует 0
- основанная индексация для зонда определила номера. Например, CDFStruct.ProbeSets(1)
имеет ProbeSetNumber
из 0
в ProbePairs
поле .
probesetplot (
вызовы CELStruct
, CDFStruct
, PS
PropertyName
', PropertyValue
, ...)probesetplot
с дополнительными свойствами, которые используют имя свойства / пары значения свойства. Можно задать одно или несколько свойств в любом порядке. Каждый PropertyName
должен быть заключен в одинарные кавычки и нечувствительный к регистру. Это имя свойства / пары значения свойства следующие:
probesetplot(
средства управления, определил ли зонд имя или название гена, используются для заголовка графика. Выбором является CELStruct
, CDFStruct
, PS
,
...'GeneName', GeneNameValue
, ...)true
или false
(значение по умолчанию).
Примечание
'GeneName'
свойство требует, чтобы файл библиотеки GIN, сопоставленный с CEL и CDF-файлами, был расположен в той же папке как файл библиотеки CDF от который CDFStruct
был создан.
probesetplot(
задает тип данных, чтобы построить. Выбор: CELStruct
, CDFStruct
, PS
,
...'Field', FieldValue
, ...)
'Intensity'
(значение по умолчанию)
'StdDev'
'Background'
'Pixels'
'Outlier'
probesetplot(
средства управления, включены ли линии среднего и стандартного отклонения в график. Выбором является CELStruct
, CDFStruct
, PS
,
...'ShowStats', ShowStatsValue
, ...)true
или false
(значение по умолчанию).
affyread
| celintensityread
| probesetlink
| probesetlookup
| probesetvalues