Класс: BioMap
Получение показателей качества отображения последовательности из BioMap объект
MappingQuality = getMappingQuality(BioObj)
MappingQuality = getMappingQuality(BioObj, Subset)
MappingQuality = getMappingQuality(BioObj)MappingQualityвектор целых чисел, задающий показатели качества отображения для каждой считанной последовательности в BioObj, a BioMap объект.
MappingQuality = getMappingQuality(BioObj, Subset)Subset.
|
Объект |
|
Одно из следующих действий для указания подмножества элементов в
Примечание Если для указания используется массив заголовков ячеек |
|
|
Построить BioMap и затем извлеките оценки качества отображения для различных элементов в объекте:
% Construct a BioMap object from a SAM file
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Retrieve the mapping quality property of the second element in
% the object
MQ_2 = getMappingQuality(BMObj1, 2)MQ_2 = 99
% Retrieve the mapping quality properties of the first and third % elements in the object MQ_1_3 = getMappingQuality(BMObj1, [1 3])
MQ_1_3 = 99 99
% Retrieve the mapping quality properties of all elements in the % object MQ_All = getMappingQuality(BMObj1);
Альтернатива использованию getMappingQuality метод заключается в использовании индексации точек с помощью MappingQuality свойство:
BioObj.MappingQuality(Indices)
В предыдущем синтаксисе Indices - вектор положительных целых чисел или логический вектор. Indices не может быть массивом ячеек символьных векторов или строковых векторов, содержащих заголовки последовательностей.