exponenta event banner

getReference

Класс: BioMap

Получение ссылочной последовательности из BioMap объект

Синтаксис

Ref = getReference(BioObj)

Описание

Ref = getReference(BioObj) возвращает имя ссылочной последовательности из BioMap объект. Это Reference свойства объекта.

Входные аргументы

BioObj

Объект BioRead или BioMap класс.

Выходные аргументы

Ref

Reference имущество BioObj, BioMap объект. Это символьный или строковый вектор, указывающий имя ссылочной последовательности.

Примеры

Построить BioMap и затем извлеките ссылочную последовательность из объекта:

% Construct a BioMap object from a SAM file 
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Retrieve the reference sequence from the object
refSeq = getReference(BMObj1)
refSeq =

seq1

Альтернативы

Альтернатива использованию getReference метод заключается в использовании индексации точек с помощью Reference свойство:

BioObj.Reference