getequations

Система возврата уравнений для объекта модели

Синтаксис

equations = getequations(modelobj) equations = getequations(modelobj,configsetobj,variantobj,doseobj)

Описание

equations = getequations(modelobj) прибыль equations, символьный вектор, содержащий систему уравнений, которые представляют modelobj, a model object. Функция использует любой активный конфигурационный набор, активные варианты и активные дозы, если таковые имеются, и генерирует систему уравнений. Необходимо указать детерминированный решатель.

equations = getequations(modelobj,configsetobj,variantobj,doseobj) возвращает систему уравнений, которые представляют модель, заданную Model объект, Variant объекты и дозовые объекты (RepeatDose или ScheduleDose). Для создания уравнений функция использует только указанные конфигурационный набор, дозы и варианты. Любые другие конфигурационные элементы, дозы и варианты игнорируются. Необходимо указать детерминированный решатель.

Если установить csObj кому [], то функция использует активный объект configset.

Если установить variantObj кому [], то функция не использует вариантов.

Если установить doseObj кому [], тогда функция не использует дозы.

Входные аргументы

`modelobj`	Объект `Model` класс. Примечание При использовании `modelobj` как единственный входной аргумент, активный `Configset` объект должен указывать детерминированный решатель.
`configsetobj`	Объект `Configset` класс. Этот объект должен указывать детерминированный решатель. По умолчанию: `[]` (Пустое, указывающее активное `Configset` объект для `modelobj`)
`variantobj`	Объект или массив объектов `Variant` класс. По умолчанию: `[]` (пустое значение, которое указывает на отсутствие объекта варианта)
`doseobj`	Объект или массив объектов `RepeatDose` или `ScheduleDose` класс. По умолчанию: `[]` (Пусто, что указывает на отсутствие дозового объекта)

Выходные аргументы

equations

Символьный вектор, содержащий систему уравнений, представляющих модель. Включены уравнения для реакций, правил, событий, вариантов и доз.

Примеры

развернуть все

Просмотр системы уравнений для простой модели

Просмотр системы уравнений, представляющих простую модель, содержащую только реакции.

Импортируйте модель lotka, включенную в SimBiology ®, в переменную с именемmodel1:

model1 = sbmlimport('lotka');

Просмотр всех уравнений, представляющих model1 модель и ее активный конфигурационный набор:

m1equations = getequations(model1)

m1equations =

ODEs:
d(y1)/dt = 1/unnamed*(ReactionFlux1 - ReactionFlux2)
d(y2)/dt = 1/unnamed*(ReactionFlux2 - ReactionFlux3)
d(z)/dt = 1/unnamed*(ReactionFlux3)

Fluxes:
ReactionFlux1 = c1*y1*x
ReactionFlux2 = c2*y1*y2
ReactionFlux3 = c3*y2

Parameter Values:
c1 = 10
c2 = 0.01
c3 = 10
unnamed = 1

Initial Conditions:
x = 1
y1 = 900
y2 = 900
z = 0

MATLAB ® отображает ODE, потоки, значения параметров и начальные условия для реакций вmodel1.

Просмотр системы уравнений для модели и дозы

Просмотр системы уравнений, представляющих модель, содержащую только реакции и повторяющуюся дозу.

Импорт модели lotka, включенной в SimBiology, в переменную с именем model1:

model1 = sbmlimport('lotka');

Добавьте повторную дозу к модели:

doseObj1 =  adddose(model1,'dose1','repeat');

Установить свойства дозы, чтобы вводить 3 мг, со скоростью 10 мг/час, 6 раз, с интервалом каждые 24 часов, видам y1:

doseObj1.Amount = 0.003;
doseObj1.AmountUnits = 'gram';
doseObj1.Rate = 0.010;
doseObj1.RateUnits = 'gram/hour';
doseObj1.Repeat = 6;
doseObj1.Interval = 24;
doseObj1.TimeUnits = 'hour';
doseObj1.TargetName = 'y1';

Просмотр всех уравнений, представляющих model1 модель, ее активный конфигурационный набор и повторная доза:

m1_with_dose_equations = getequations (model1,[],[],doseObj1)

m1_with_dose_equations =

ODEs:
d(y1)/dt = 1/unnamed*(ReactionFlux1 - ReactionFlux2) + dose1
d(y2)/dt = 1/unnamed*(ReactionFlux2 - ReactionFlux3)
d(z)/dt = 1/unnamed*(ReactionFlux3)

Fluxes:
ReactionFlux1 = c1*y1*x
ReactionFlux2 = c2*y1*y2
ReactionFlux3 = c3*y2

Parameter Values:
c1 = 10
c2 = 0.01
c3 = 10
unnamed = 1

Initial Conditions:
y1 = 900
y2 = 900
z = 0
x = 1

Doses:
Variable                      Type                Units               
dose1                         repeatdose          gram

MATLAB отображает ODE, потоки, значения параметров и начальные условия для реакций и дозы в model1.

Совет

Использовать getequations для просмотра системы уравнений, представляющих модель для:

Цели публикации
Отладка модели

См. также

Configset object | Model object | RepeatDose object | ScheduleDose object | Variant object

Темы

Показать уравнения модели и начальные условия

Документация