Определение протокола дозирования лекарств
A RepeatDose объект определяет ряд доз к количеству вида во время моделирования. TargetName свойство дозового объекта определяет вид, получающий дозу.
Каждая доза является одинаковым количеством, как определено Amount свойства, и даны в равноотстоящие моменты времени, как определено Interval собственность. RepeatCount свойство определяет количество инъекций в серии, исключая начальную инъекцию. Rate свойство определяет, как быстро дается каждая доза.
Чтобы использовать объект дозы в моделировании, необходимо добавить объект дозы к объекту модели и задать Active свойство объекта дозы true. Установите Active true, если всегда требуется применить дозу перед моделированием модели.
Предупреждение
Active имущества RepeatDose object будет удален в следующем выпуске. Явное указание дозы или массива доз в качестве входного аргумента при моделировании модели с использованием sbiosimulate.
Если в модели имеется несколько активных объектов RepeatDose и имеются повторяющиеся спецификации для значения свойства, во время моделирования используется последнее вхождение для значения свойства в массиве доз. Вы можете узнать, какая доза применяется последней, посмотрев на индексы объектов дозы, сохраненных в модели.
Для параметров модели можно задать следующие свойства дозы: Amount, Interval, Rate, RepeatCount, StartTime, LagParameterName и DurationParameterName. Эти свойства можно задать, за исключением LagParameterName и DurationParameterName, либо числовое значение, либо имя параметра в области модели (в виде символьного вектора или строки). Параметризация свойств дозы обеспечивает большую гибкость для различных применений дозирования, таких как масштабирование количества дозы по массе тела. Дополнительные сведения см. в разделе Параметризованные и адаптивные дозы.
| sbiodose | Построить дозовый объект |
Методы для RepeatDose объекты
| copyobj | Копировать объект SimBiology и его нижестоящие элементы |
| удалить | Удалить объект SimBiology |
| показ | Отображение сводки объекта SimBiology |
| добраться | Получение свойств объекта SimBiology |
| getTable (SchediceDose, RepeatDose) | Возвращаемые данные из объекта дозы SimBiology в виде таблицы |
| переименовать | Переименование объекта и обновление выражений |
| набор | Задать свойства объекта SimBiology |
| setTable (Расписание Доза, Повторяющаяся Доза) | Установить дозирующую информацию из таблицы в дозовый объект |
Свойства для RepeatDose объекты
| Активный | Указать объект, используемый во время моделирования |
| Сумма | Количество дозы |
| AmountUnits | Единицы количества дозы |
| DurationParameterName | Параметр, определяющий продолжительность времени введения дозы |
| EventMode | Определить, как события, изменяющие параметры дозы, влияют на текущее дозирование |
| Интервал | Время между дозами |
| LagParameterName | Параметр, определяющий временной лаг для дозы |
| Имя | Укажите имя объекта |
| Примечания | HTML-текст, описывающий объект SimBiology |
| Родитель | Указать родительский объект |
| Уровень | Скорость дозы |
| RateUnits | Единицы измерения мощности дозы |
| RepeatCount | Повторы доз |
| StartTime | Время начала начальной дозы |
| Тэг | Укажите метку для объекта SimBiology |
| TargetName | Виды, получающие дозу |
| TimeUnits | Показать единицы времени для дозирования и моделирования |
| Напечатать | Отображение типа объекта SimBiology |
| UserData | Укажите данные для связывания с объектом |
Параметризовать Amount свойство дозы масштабировать ее по массе тела пациента.
Создайте простую модель с линейным исключением и параметром величины.
model = sbiomodel('simple model'); compartment = addcompartment(model,'Central',1); compartment.CapacityUnits = 'liter'; species = addspecies(model,'drug'); species.InitialAmountUnits = 'milligram'; % Elimination rate elimParam = addparameter(model,'kel',0.1); elimParam.ValueUnits = '1/hour'; % Elimination reaction reaction = addreaction(model,'drug -> null'); reaction.ReactionRate = 'kel*drug'; amountParam = addparameter(model,'A',50); amountParam.ConstantValue = false; amountParam.ValueUnits = 'milligram'
amountParam = SimBiology Parameter Array Index: Name: Value: Units: 1 A 50 milligram
Создание дозы с ее помощью Amount свойство имеет значение параметра amount 'A'.
dose = adddose(model,'adaptive dose','repeat'); dose.Amount = 'A';
Задайте другие свойства дозы.
dose.TargetName = 'drug'; dose.StartTime = 0; dose.TimeUnits = 'hour'; dose.Interval = 24; dose.RepeatCount = 7;
Добавьте параметр для представления массы тела.
weightParam = addparameter(model,'weight', 80); weightParam.ValueUnits = 'kilogram';
Масштабируйте количество дозы по массе тела, используя правило начального назначения.
scaleParam = addparameter(model,'doseAmountPerWeight',0.6); scaleParam.ValueUnits = 'milligram/kilogram'; rule = addrule(model,'A = weight*doseAmountPerWeight','initialAssignment');
Смоделировать модель в течение 7 дней и построить график результатов.
configset = getconfigset(model); configset.StopTime = 7*24; configset.TimeUnits = 'hour'; [time, drugAndAmount] = sbiosimulate(model,dose); plot(time, drugAndAmount); legend('drug','A');
Создайте простую модель с линейным исключением, параметром суммы и параметром скорости.
model = sbiomodel('simple model'); compartment = addcompartment(model,'Central',1); compartment.CapacityUnits = 'liter'; species = addspecies(model,'drug'); species.InitialAmountUnits = 'milligram'; % Elimination rate elimParam = addparameter(model,'kel',0.1); elimParam.ValueUnits = '1/hour'; % Elimination reaction reaction = addreaction(model,'drug -> null'); reaction.ReactionRate = 'kel*drug'; % Add amount and rate parameters amountParam = addparameter(model,'A',50); amountParam.ConstantValue = false; amountParam.ValueUnits = 'milligram'
amountParam = SimBiology Parameter Array Index: Name: Value: Units: 1 A 50 milligram
rateParam = addparameter(model,'R',10); rateParam.ValueUnits = 'milligram/hour'
rateParam = SimBiology Parameter Array Index: Name: Value: Units: 1 R 10 milligram/hour
Создание дозы с ее помощью Amount и Rate для свойств установлены параметры величины и скорости «A» и «R» соответственно.
dose = adddose(model,'adaptive dose','repeat'); dose.Amount = 'A'; dose.Rate = 'R';
Задайте другие свойства дозы.
dose.TargetName = 'drug'; dose.StartTime = 0; dose.TimeUnits = 'hour'; dose.Interval = 24; dose.RepeatCount = 7;
Подготовьте набор конфигурации для моделирования модели в течение 7 дней.
configset = getconfigset(model);
configset.StopTime = 7*24;
configset.TimeUnits = 'hour';Добавьте событие, чтобы сбросить количество дозы до 10 в момент времени > = 26.
event = addevent(model,'time >= 26','A = 10');
Установите EventMode для свойства stop. Эта настройка приводит к тому, что любое продолжающееся событие дозы останавливается на 26 часах.
dose.EventMode = 'stop';Моделирование модели. Событие второй дозы останавливается на 26 часах, и последующие события дозы продолжаются с новым количеством дозы 10.
[time, drugAndAmount] = sbiosimulate(model,dose); figure plot(time, drugAndAmount); legend('drug','A');
Кроме того, можно разрешить завершение текущего события дозы перед применением нового количества дозы путем установки EventMode для продолжения.
dose.EventMode = 'continue';Моделирование модели. При этом событие второй дозы продолжается до 26 часов.
[time, drugAndAmount] = sbiosimulate(model,dose); figure plot(time, drugAndAmount); legend('drug','A');
Model object | sbiodose | sbiosimulate | ScheduleDose object