Проверка и проверка модели SimBiology
verify( выполняет проверки для modelObj)Model
modelObj для проверки возможности моделирования модели. Эта функция генерирует накопленные ошибки и предупреждения при обнаружении каких-либо проблем. Для просмотра всего списка ошибок и предупреждений используйте sbiolasterror и sbiolastwarning. Функция использует активный набор конфигурации, любые активные дозы и активные варианты для проверки.
verify( проверка модели modelObj,dvObj)modelObj используя дозы или варианты, указанные dvObj и активный конфигурационный набор. dvObj может быть одним из следующих:
Массив доз или вариантов
Если установить dvObj опустеть []функция использует активный конфигурационный набор, активные варианты и активные дозы.
При указании dvObj в качестве вариантов функция использует указанные варианты и активные дозы. Любые другие варианты игнорируются.
При указании dvObj в качестве доз функция использует указанные дозы и активные варианты. Любые другие дозы игнорируются.
verify( проверка модели modelObj,csObj,dvObj)modelObj использование объекта configset csObj и дозы или варианты, указанные dvObj.
Если установить csObj кому [], то функция использует активный объект configset.
Если установить dvObj кому [], то функция не использует вариантов, но использует активные дозы.
При указании dvObj в качестве вариантов функция использует указанные варианты и активные дозы. Любые другие варианты игнорируются.
При указании dvObj в качестве доз функция использует указанные дозы и активные варианты. Любые другие дозы игнорируются.
verify( проверка модели modelObj,csObj,variantObj,doseObj)modelObj использование объекта configset csObj, варианты (variantObj) и дозы (doseObj). Любые другие конфигурационные элементы, дозы и варианты игнорируются.
Если установить csObj кому [], то функция использует активный объект configset.
Если установить variantObj кому [], то функция не использует вариантов.
Если установить doseObj кому [], тогда функция не использует дозы.
Загрузите образец модели SimBiology.
sbioloadproject radiodecay.sbprojДобавьте новый набор конфигурации, используя другое время остановки, равное 15 секундам.
csObj = addconfigset(m1,'newStopTimeConfigSet');
csObj.StopTime = 15;Проверьте модель при использовании объекта configset.
verify(m1,csObj);
После проверки проверьте наличие последних ошибок и предупреждений.
sbiolasterror
ans =
0x1 empty struct array with fields:
Type
MessageID
Message
sbiolastwarning
ans =
0x1 empty struct array with fields:
Type
MessageID
Message
Моделирование модели.
sim = sbiosimulate(m1,csObj); sbioplot(sim);
Загрузите образец модели SimBiology.
sbioloadproject radiodecay.sbprojПолучение набора конфигурации по умолчанию из модели.
defaultConfigSet = getconfigset(m1,'default');Добавить запланированную дозу 100 молекул через 2 секунды для видов x.
dObj = adddose(m1,'d1','schedule'); dObj.Amount = 100; dObj.AmountUnits = 'molecule'; dObj.TimeUnits = 'second'; dObj.Time = 2; dObj.TargetName = 'unnamed.x';
Проверьте модель, используя объект конфигурации по умолчанию и добавленный объект дозы.
verify(m1,defaultConfigSet,dObj);
После проверки проверьте наличие последних ошибок и предупреждений.
sbiolasterror
ans =
0x1 empty struct array with fields:
Type
MessageID
Message
sbiolastwarning
ans =
0x1 empty struct array with fields:
Type
MessageID
Message
Моделирование модели с использованием одних и тех же объектов configset и dose.
sim = sbiosimulate(m1,defaultConfigSet,dObj);
Постройте график результата.
sbioplot(sim);
Загрузите образец модели SimBiology.
sbioloadproject radiodecay.sbprojДобавьте новый набор конфигурации, используя другое время остановки, равное 15 секундам.
csObj = m1.addconfigset('newStopTimeConfigSet');
csObj.StopTime = 15;Добавить запланированную дозу 100 молекул через 2 секунды для видов x.
dObj = adddose(m1,'d1','schedule'); dObj.Amount = 100; dObj.AmountUnits = 'molecule'; dObj.TimeUnits = 'second'; dObj.Time = 2; dObj.TargetName = 'unnamed.x';
Добавление варианта вида x с использованием другого начального количества 500 молекул.
vObj = addvariant(m1,'v1'); addcontent(vObj,{'species','x','InitialAmount',500});
Проверьте модель при использовании объектов configset, dose и variant. Обратите внимание, что порядок аргументов должен соответствовать описанию.
verify(m1,csObj,vObj,dObj);
После проверки проверьте наличие последних ошибок и предупреждений.
sbiolasterror
ans =
0x1 empty struct array with fields:
Type
MessageID
Message
sbiolastwarning
ans =
0x1 empty struct array with fields:
Type
MessageID
Message
Моделирование модели с использованием тех же объектов configset, variant и dose.
sim = sbiosimulate(m1,csObj,vObj,dObj);
Постройте график результата.
sbioplot(sim);
