Класс: модель GeneralizedLinearDepartedModel
Отображение обобщенной линейной модели смешанных эффектов
glme - Обобщенная линейная модель смешанных эффектовGeneralizedLinearMixedModel объектОбобщенная линейная модель смешанных эффектов, указанная как GeneralizedLinearMixedModel объект. Свойства и методы этого объекта см. в разделе GeneralizedLinearMixedModel.
Загрузите образцы данных.
load mfrЭти смоделированные данные получены от производственной компании, которая эксплуатирует 50 заводов по всему миру, причем на каждом заводе выполняется пакетный процесс создания готового продукта. Компания хочет уменьшить количество дефектов в каждой партии, поэтому разработала новый производственный процесс. Чтобы проверить эффективность нового процесса, компания выбрала 20 своих заводов случайным образом для участия в эксперименте: Десять заводов реализовали новый процесс, в то время как другие десять продолжали запускать старый процесс. На каждом из 20 заводов компания провела пять партий (всего 100 партий) и записала следующие данные:
Флаг, указывающий, использовала ли партия новый процесс (newprocess)
Время обработки для каждой партии, в часах (time)
Температура партии, в градусах Цельсия (temp)
Категориальная переменная, указывающая поставщика химического вещества, используемого в партии (supplier)
Количество дефектов в партии (defects)
Данные также включают time_dev и temp_dev, которые представляют собой абсолютное отклонение времени и температуры соответственно от технологического стандарта 3 часов при 20 градусах Цельсия.
Подгонка обобщенной линейной модели смешанных эффектов с использованием newprocess, time_dev, temp_dev, и supplier в качестве предикторов с фиксированными эффектами. Включить термин случайных эффектов для перехвата, сгруппированного по factory, чтобы учесть различия в качестве, которые могут существовать из-за специфичных для завода вариаций. Переменная ответа defects имеет распределение Пуассона, и соответствующей функцией связи для этой модели является log. Для оценки коэффициентов используется метод аппроксимации Лапласа. Укажите фиктивную кодировку переменной как 'effects'так что фиктивные переменные коэффициенты суммируются до 0.
Количество дефектов можно смоделировать с помощью распределения Пуассона
)
Это соответствует обобщенной линейной модели смешанных эффектов
β5supplier _ Bij + bi,
где
- количество дефектов, наблюдаемых в партии, произведенной заводом во время партии .
- среднее число дефектов, соответствующих заводу (где 20) во время партии j (..., 5).
, и являются измерениями для каждой переменной, которые соответствуют фабрике i во время партии jНапример, указывает, использовала ли партия, произведенная заводом i во время партии j, новый процесс.
и являются фиктивными переменными, которые используют кодирование эффектов (сумма к нулю), чтобы указать, C или B, соответственно, поставлялись технологические химикаты для партии, произведенной заводом во время партии .
startb2) - перехват случайных эффектов для каждой i, который учитывает специфичные для фабрики вариации качества.
glme = fitglme(mfr,'defects ~ 1 + newprocess + time_dev + temp_dev + supplier + (1|factory)','Distribution','Poisson','Link','log','FitMethod','Laplace','DummyVarCoding','effects');
Отображение модели.
disp(glme)
Generalized linear mixed-effects model fit by ML
Model information:
Number of observations 100
Fixed effects coefficients 6
Random effects coefficients 20
Covariance parameters 1
Distribution Poisson
Link Log
FitMethod Laplace
Formula:
defects ~ 1 + newprocess + time_dev + temp_dev + supplier + (1 | factory)
Model fit statistics:
AIC BIC LogLikelihood Deviance
416.35 434.58 -201.17 402.35
Fixed effects coefficients (95% CIs):
Name Estimate SE tStat DF pValue
{'(Intercept)'} 1.4689 0.15988 9.1875 94 9.8194e-15
{'newprocess' } -0.36766 0.17755 -2.0708 94 0.041122
{'time_dev' } -0.094521 0.82849 -0.11409 94 0.90941
{'temp_dev' } -0.28317 0.9617 -0.29444 94 0.76907
{'supplier_C' } -0.071868 0.078024 -0.9211 94 0.35936
{'supplier_B' } 0.071072 0.07739 0.91836 94 0.36078
Lower Upper
1.1515 1.7864
-0.72019 -0.015134
-1.7395 1.5505
-2.1926 1.6263
-0.22679 0.083051
-0.082588 0.22473
Random effects covariance parameters:
Group: factory (20 Levels)
Name1 Name2 Type Estimate
{'(Intercept)'} {'(Intercept)'} {'std'} 0.31381
Group: Error
Name Estimate
{'sqrt(Dispersion)'} 1
Model information таблица отображает общее количество наблюдений в данных выборки (100), количество коэффициентов фиксированных и случайных эффектов (6 и 20 соответственно) и количество параметров ковариации (1). Это также указывает, что переменная ответа имеет Poisson распределение, функция линии связи Log, и метод подгонки Laplace.
Formula указывает спецификацию модели с помощью нотации Уилкинсона.
Model fit statistics В таблице представлены статистические данные, используемые для оценки соответствия модели. Это включает в себя информационный критерий Акаике (AIC), байесовский информационный критерий (BIC) значения, логарифмическое правдоподобие (LogLikelihood) и отклонение (Deviance) значения.
Fixed effects coefficients таблица показывает, что fitglme возвращены 95% доверительные интервалы. Он содержит одну строку для каждого предиктора с фиксированными эффектами, и каждый столбец содержит статистику, соответствующую этому предиктору. Столбец 1 (Name) содержит имя каждого коэффициента с фиксированными эффектами, столбец 2 (Estimate) содержит его оценочное значение и столбец 3 (SE) содержит стандартную ошибку коэффициента. Колонка 4 (tStat) содержит t-статистику для проверки гипотезы, что коэффициент равен 0. Столбец 5 (DF) и колонку 6 (pValue) содержат степени свободы и p-значение, которые соответствуют t-статистике соответственно. Последние два столбца (Lower и Upper) отображать нижний и верхний пределы, соответственно, 95% доверительного интервала для каждого коэффициента с фиксированными эффектами.
Random effects covariance parameters отображает таблицу для каждой переменной группировки (здесь, только factory), включая его общее количество уровней (20), и тип и оценку параметра ковариации. Здесь, std указывает, что fitglme возвращает стандартное отклонение случайного эффекта, связанного с заводским предиктором, которое имеет оценочное значение 0,31381. Также отображается таблица, содержащая тип параметра ошибки (здесь квадратный корень параметра дисперсии) и его оценочное значение 1.
Стандартный экран, созданный fitglme не обеспечивает доверительные интервалы для параметров случайных эффектов. Для вычисления и отображения этих значений используйте covarianceParameters.
Информационным критерием Акайке (AIC) является AIC = -2logLM + 2 (param).
logLM зависит от метода, используемого для подгонки модели.
Если вы используете 'Laplace' или 'ApproximateLaplace', то logLM является максимизированным логарифмическим правдоподобием.
Если вы используете 'MPL', то logLM является максимизированным логарифмическим правдоподобием псевдоданных из окончательной псевдопонятной итерации.
Если вы используете 'REMPL', то logLM является максимизированным ограниченным логарифмическим правдоподобием псевдоданных из окончательной псевдопонятной итерации.
param - общее число параметров, оцененных в модели. Для большинства моделей GLME param равен nc + p + 1, где nc - общее число параметров в ковариации случайных эффектов, исключая остаточную дисперсию, а p - число коэффициентов фиксированных эффектов. Однако если параметр дисперсии зафиксирован на уровне 1,0 для биномиальных или пуассоновских распределений, то param равен (nc + p).
Байесовский информационный критерий (BIC) - BIC = -2 * logLM + ln (neff) (param).
logLM зависит от метода, используемого для подгонки модели.
Если вы используете 'Laplace' или 'ApproximateLaplace', то logLM является максимизированным логарифмическим правдоподобием.
Если вы используете 'MPL', то logLM является максимизированным логарифмическим правдоподобием псевдоданных из окончательной псевдопонятной итерации.
Если вы используете 'REMPL', то logLM является максимизированным ограниченным логарифмическим правдоподобием псевдоданных из окончательной псевдопонятной итерации.
neff - это эффективное количество наблюдений.
Если вы используете 'MPL', 'Laplace', или 'ApproximateLaplace', то neff = n, где n - число наблюдений.
Если вы используете 'REMPL', то neff = n - p.
param - общее число параметров, оцененных в модели. Для большинства моделей GLME param равен nc + p + 1, где nc - общее число параметров в ковариации случайных эффектов, исключая остаточную дисперсию, а p - число коэффициентов фиксированных эффектов. Однако если параметр дисперсии зафиксирован на уровне 1,0 для биномиальных или пуассоновских распределений, то param равен (nc + p).
Меньшее значение отклонения указывает на лучшую подгонку. По мере уменьшения величины отклонения как AIC, так и BIC имеют тенденцию к снижению. Как AIC, так и BIC также включают штрафные сроки, основанные на количестве оцениваемых параметров, p. Таким образом, когда количество параметров увеличивается, значения AIC и BIC также имеют тенденцию увеличиваться. При сравнении различных моделей модель с наименьшим значением AIC или BIC рассматривается как наиболее подходящая модель.
Для моделей, устанавливаемых с использованием 'MPL' и 'REMPL'AIC и BIC основаны на логарифмическом правдоподобии (или ограниченном логарифмическом правдоподобии) псевдоданных из окончательной псевдопонятной итерации. Поэтому прямое сравнение значений AIC и BIC между моделями, установленными с использованием 'MPL' и 'REMPL' не подходит.
covarianceParameters | fitglme | GeneralizedLinearMixedModel
Имеется измененная версия этого примера. Открыть этот пример с помощью изменений?
1. Если смысл перевода понятен, то лучше оставьте как есть и не придирайтесь к словам, синонимам и тому подобному. О вкусах не спорим.
2. Не дополняйте перевод комментариями “от себя”. В исправлении не должно появляться дополнительных смыслов и комментариев, отсутствующих в оригинале. Такие правки не получится интегрировать в алгоритме автоматического перевода.
3. Сохраняйте структуру оригинального текста - например, не разбивайте одно предложение на два.
4. Не имеет смысла однотипное исправление перевода какого-то термина во всех предложениях. Исправляйте только в одном месте. Когда Вашу правку одобрят, это исправление будет алгоритмически распространено и на другие части документации.
5. По иным вопросам, например если надо исправить заблокированное для перевода слово, обратитесь к редакторам через форму технической поддержки.