Exponenta Banner

getInfo

Класс: BioMap

Извлечение информации для одного элемента BioMap объект

Синтаксис

Info = getInfo(BioObj, Element)

Описание

Info = getInfo(BioObj, Element) возвращает Info, вектор символов с разделителем табуляцией, содержащий информацию об одном элементе в BioObj, а BioMap объект.

Входные параметры

BioObj

Объект BioMap класс.

Element

Одно из следующих для задания одного элемента в BioObj:

  • Скаляр, задающий индекс элемента

  • Логический вектор

  • Вектор символов, содержащий допустимый заголовок последовательности

Выходные аргументы

Info

Разделенный табуляцией вектор символов, содержащий информацию об одном элементе в BioObj, а BioMap объект. Вектор символов содержит информацию из следующих свойств в порядке:

  • Header

  • Flag

  • Start

  • MappingQuality

  • Signature

  • Sequence

  • Quality

Примеры

Создайте a BioMap и затем извлеките информацию для второго элемента объекта:

% Construct a BioMap object from a SAM file 
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Retrieve information for the second element in the object
element2Info = getInfo(BMObj1, 2)
element2Info =

EAS54_65:7:152:368:113	73	3	99	35M	
CTAGTGGCTCATTGTAAATGTGTGGTTTAACTCGT	
<<<<<<<<<<0<<<<655<<7<<<:9<<3/:<6):

См. также

Темы

Внешние веб-сайты

Документация по Bioinformatics Toolbox

Поддержка