Анализ данных масс-спектрометрии
Функции масс-спектрометрии предварительно обрабатывают и классифицируют необработанные данные из спектрометров SELDI-TOF и MALDI-TOF и используют статистические функции обучения для идентификации шаблонов.
Чтение необработанных данных - Загрузка необработанных данных массы/заряда и интенсивности ионов из файлов с значениями (CSV) или чтение файла с форматированием JCAMP-DX с данными масс-спектрометрии (jcampread) в MATLAB® окружение.
Вы также можете иметь данные в файлах TXT и использовать importdata функция.
Предварительная обработка необработанных данных - повторная выборка данных с высоким разрешением в более низкое разрешение (msresample) где дополнительные точки данных не нужны. Исправьте базовую линию (msbackadj). Выровняйте спектр по множеству ссылок (msalign) и визуально проверить выравнивание (msheatmap). Нормализуйте область между спектрами для сравнения (msnorm), и отфильтровать шум (mslowess и mssgolay).
Спектральный анализ - Спектры нагрузки в графический интерфейс пользователя (msviewer) для выбора peaks масс и последующего анализа.
Следующий рисунок иллюстрирует роли различных функций масс-спектрометрии в тулбоксе.
