niftiread

Чтение изображения NIfTI

Свернуть все на странице

Синтаксис

V = niftiread(filename)
V = niftiread(headerfile,imgfile)
V = niftiread(info)

Описание

пример

V = niftiread(filename) считывает файл изображения NIfTI, заданный filename в текущей папке или на пути и возвращает объемные данные в V. The niftiread функция поддерживает оба NIfTI1 и NIfTI2 форматы файлов.

V = niftiread(headerfile,imgfile) читает заголовочный файл NIfTI (.hdr) и файл изображений (.img) пара.

пример

V = niftiread(info) читает файл NIfTI, описанный структурой метаданных info. Как создать info structure, использовать niftiinfo функция

Примеры

свернуть все

Открыть Live Script

Загрузка объемных данных из файла NIfTI. Файл использует объединенный формат NIfTI - изображение и метаданные находятся в одном файле. Этот тип файла NIfTI имеет расширение .nii.

V = niftiread('brain.nii');

Просмотрите переменную в рабочей области.

whos V
  Name        Size                  Bytes  Class    Attributes

  V         256x256x21            1376256  uint8
Открыть Live Script

Считайте метаданные из файла NIfTI. 

info = niftiinfo('brain.nii');

Считайте объемное изображение с помощью структуры метаданных, возвращаемой niftiinfo.

V = niftiread(info);

Просмотрите переменную в рабочей области.

whos V
  Name        Size                  Bytes  Class    Attributes

  V         256x256x21            1376256  uint8

Входные параметры

свернуть все

Имя файла NIfTI, заданное как строковый скаляр или вектор символов. Файл может быть в NIfTI1 или NIfTI2 формат файла.

  • Если вы не задаете расширение файла, то niftiread ищет файл с .nii расширение.

  • Если niftiread не удается найти файл с .nii расширение, затем он ищет gzipped версию файла с расширением .nii.gz.

  • Если niftiread не удается найти файл с .nii.gz расширение, затем он ищет файл с .hdr, .hdr.gz, .img, или .img.gz расширение файла.

  • Если niftiread не удается найти файл, соответствующий любому из этих опций, после чего возвращается ошибка.

Типы данных: char | string

Имя файла, содержащего метаданные, заданное как строковый скаляр или вектор символов. Файл заголовка NIfTI (.hdr) содержит метаданные, сопоставленные с томом NIfTI. Если вы не задаете соответствующее imgfile, затем niftiread ищет в той же папке файл с таким же именем и расширением .img.

Типы данных: char | string

Имя файла, содержащего том, заданное как строковый скаляр или вектор символов. Файл изображения NIfTI (.img) содержит объемные данные. Если вы не задаете соответствующий заголовочный файл, то niftiread ищет в той же папке файл с таким же именем и расширением .hdr.

Типы данных: char | string

Метаданные файла NIfTI, заданные как структура, возвращаемая niftiinfo.

Типы данных: struct

Выходные аргументы

свернуть все

Объемные данные, возвращенные как числовой массив.

Подробнее о

свернуть все

Формат файла NifTI

NIfTI (Neuroimaging Informatics Technology Initiative) является рабочей группой, спонсируемой NIH, для содействия совместимости функциональных инструментов нейровизуализации. В NIfTI используется один или два формата хранения файлов.

  • Двойной формат файла хранит данные в паре файлов: заголовочный файл (.hdr) содержащие метаданные и файл данных (.img) содержащие данные изображения.

  • Формат одного файла сохраняет данные в одном файле (.nii), который содержит информацию заголовка, за которой следуют данные изображения.

Ссылки

[1] Кокс, Р. У., Дж. Эшбернер, Х. Бреман, К. Фиссел, К. Хазельгроув, К. Дж. Холмс, Дж. Л. Ланкастер, Д. Э. Рекс, С. М. Смит, Дж. Б. Вудворд и С. К. Стротер. «Стандарт нового формата данных: NiFTI-1.» 10-е ежегодное совещание Организации по отображению мозга человека, Будапешт, Венгрия, июнь 2004 года.

См. также

|

Введенный в R2017b

Документация по Image Processing Toolbox

Поддержка

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте