Сетевой анализ и визуализация
Примените основные алгоритмы теории графов к Взаимодействиям белка белка (PPI) и другим генным сетям; просмотрите сетевые отношения с помощью интерактивных карт, графиков иерархии и трасс
Используйте различные алгоритмы графика, чтобы анализировать генные сети и взаимодействия белка белка. Представляйте различные типы графиков с помощью разреженных матриц. Визуализируйте графики и сетевые отношения с помощью biograph объект, который позволяет вам вычислить положение узлов, чертит график и находит отношения между узлами.
Функции
graphallshortestpaths | (Чтобы быть удаленным), Находят все кратчайшие пути в графике |
graphconncomp | (Чтобы быть удаленным), Находят строго или слабо соединенные компоненты в графике |
graphisdag | (Чтобы быть удаленным) Тест для циклов в ориентированном графе |
graphisomorphism | (Чтобы быть удаленным), Находят изоморфизм между двумя графиками |
graphisspantree | (Чтобы быть удаленным), Определяют, охватывает ли дерево дерево |
graphmaxflow | (Чтобы быть удаленным), Вычисляют максимальный поток в ориентированном графе |
graphminspantree | (Чтобы быть удаленным), Находят минимальное дерево охвата в графике |
graphpred2path | (Чтобы быть удаленным), Преобразуют индексы-предшественников в пути |
graphshortestpath | (Чтобы быть удаленным), Решают задачу кратчайшего пути в графике |
graphtopoorder | (Чтобы быть удаленным), Выполняют топологический вид направленного графа без петель |
graphtraverse | (Чтобы быть удаленным) график Пересечения следующими смежными узлами |
Классы
biograph | (Чтобы быть удаленным), Создают биообъект диаграмм |
biograph object | (Чтобы быть удаленным), Структура данных, содержащая типовые взаимосвязанные данные раньше, реализовывала ориентированного графа |
Темы
Функции теории графов в Bioinformatics Toolbox™ применяют основные алгоритмы теории графов к разреженным матрицам.
Bioinformatics Toolbox включает функции, объекты и методы для создания, просмотра и управления графиками, такими как интерактивные карты, графики иерархии и трассы.
