Класс: GFFAnnotation
Получите область значений аннотаций от GFFAnnotation объект
Range = getRange(AnnotObj)
Range = getRange(AnnotObj)Range, 1 2 числовой массив, задающий минимальные и максимальные положения в ссылочной последовательности, охвачен аннотациями в AnnotObj.
|
Объект |
|
1 2 числовой массив, задающий минимальные и максимальные положения в ссылочной последовательности, охвачен аннотациями в |
Создайте a GFFAnnotation объект из GFF-отформатированного файла, которому предоставляют Bioinformatics Toolbox™, и затем возвращает область значений аннотаций функции:
% Construct a GFFAnnotation object from a GFF file
GFFAnnotObj = GFFAnnotation('tair8_1.gff');
% Return first and last positions of reference associated with feature annotations
range = getRange(GFFAnnotObj)
range =
3631 498516
Используйте getSubset метод с Reference пара "имя-значение", чтобы возвратить a GFFAnnotation объект, содержащий только одну ссылочную последовательность. Затем используйте этот объект из подмножества, как введено для getRange метод.
GTFAnnotation | GFFAnnotation | getData (GFFAnnotation) | getFeatureNames (GFFAnnotation) | getIndex (GFFAnnotation) | getRange (GFFAnnotation) | getReferenceNames (GFFAnnotation) | getSubset (GFFAnnotation)