sbionca

Вычислите неразделенный на отсеки анализ (NCA) параметры (требует Statistics and Machine Learning Toolbox),

Описание

пример

ncaparameters = sbionca(data,opt) вычисляет параметры NCA из разового концентрацией data. Объект opt опций задает столбцы данных и другие опции вычисления. ncaparameters таблица расчетных значений параметров NCA для каждой группы.

Примеры

свернуть все

Загрузите синтетический набор данных, который содержит измерения концентрации препарата четырех индивидуумов после дозы болюсного внутривенного введения.

load data1.mat

Установите суммарные дозы на NaN в моментах времени, когда никакая доза не была введена.

data1.Dose(data1.Dose(:) == 0) = NaN;

Отобразите данные.

sbiotrellis(data1,'ID','Time','DrugConc','Marker','o','LineStyle','--');

Figure contains 4 axes objects. Axes object 1 with title ID 1 contains an object of type line. This object represents DrugConc. Axes object 2 with title ID 3 contains an object of type line. Axes object 3 with title ID 2 contains an object of type line. Axes object 4 with title ID 4 contains an object of type line.

Категоризируйте столбцы данных с помощью объекта опций NCA.

opt = sbioncaoptions;
opt.groupColumnName         = 'ID';
opt.concentrationColumnName = 'DrugConc';
opt.timeColumnName          = 'Time';
opt.IVDoseColumnName        = 'Dose';

Вычислите параметры NCA для каждого индивидуума.

ncaparameters = sbionca(data1,opt);

Отобразите первые несколько столбцов таблицы. Каждая строка ncaparameters таблица представляет индивидуума (или группа), и каждый списки столбцов соответствующее значение параметров NCA.

ncaparameters(:,1:15)
ans=4×15 table
    ID    doseSchedule    administrationRoute    Lambda_Z      R2       adjusted_R2    Num_points    AUC_0_last    Tlast    C_max     C_max_Dose    T_max     MRT      T_half    AUC_infinity
    __    ____________    ___________________    ________    _______    ___________    __________    __________    _____    ______    __________    _____    ______    ______    ____________

    1      {'Single'}         {'IVBolus'}        0.57893     0.99991       0.9999          11          143.61       48      74.412      1488.2        0      1.5408    1.1973       143.61   
    2      {'Single'}         {'IVBolus'}        0.66798     0.99998      0.99998          11          299.37       48      191.96      1919.6        0      1.3352    1.0377       299.37   
    3      {'Single'}         {'IVBolus'}        0.62124     0.99999      0.99999          11           766.5       48      411.06      1644.2        0      1.4476    1.1157        766.5   
    4      {'Single'}         {'IVBolus'}        0.58011     0.99995      0.99995          11          1301.8       48      648.33      1296.7        0      1.5721    1.1949       1301.8   

Можно также указать пользовательский диапазон времени, чтобы вычислить T_max и C_max в той области значений времени скажите со времени = от 0 до 20. Можно сделать так путем установки C_max_ranges свойство как массив ячеек двухэлементного вектора-строки.

opt.C_max_ranges    = {[5.5 20]};
ncaparameters2       = sbionca(data1,opt);

Функция сообщает о T_max и значениях C_max в области значений путем добавления двух новых столбцов: T_max_5_5 __ 20 и C_max_5_5 __ 20. Обратите внимание на то, что на имена этих двух столбцов, последнему моменту времени предшествуют два последовательных символа нижнего подчеркивания (__).

ncaparameters2.T_max_5_5__20(:)
ans = 4×1

     6
     6
     6
     6

ncaparameters2.C_max_5_5__20(:)
ans = 4×1

    2.2719
    3.0213
   10.0233
   19.9006

Точно так же можно указать пользовательский диапазон времени, чтобы вычислить частичное значение AUC для каждой группы.

opt.PartialAreas    = {[0 20]};
ncaparameters3      = sbionca(data1,opt);
ncaparameters3.AUC_0__20(:)
ans = 4×1
103 ×

    0.1436
    0.2994
    0.7665
    1.3017

Можно также указать диапазоны нескольких времени для C_max_ranges и PartialAreas.

opt.C_max_ranges    = {[0 20],[0 10],[0 15]};
opt.PartialAreas    = {[0 12],[0 30]};
ncaparameters4      = sbionca(data1,opt);

Входные параметры

свернуть все

Данные концентрация-время для расчета параметра NCA в виде таблицы или набора данных.

Пример: concData

Объект Options задать столбцы данных и опции вычисления в виде объекта опций NCA. Использование sbioncaoptions создать этот объект и установить опции.

Пример: ncaopt

Выходные аргументы

свернуть все

Вычисленные параметры NCA, возвращенные как таблица. Для получения дополнительной информации о том, как параметры вычисляются, смотрите Неразделенный на отсеки Анализ.

Введенный в R2017b
Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте