sbiosimulate | Модель Simulate SimBiology |
createSimFunction | Объект Create SimFunction |
sbiodose | Создайте объект дозы |
adddose | Добавьте объект дозы смоделировать |
addobservable | Добавьте заметный объект в модель SimBiology |
sbiovariant | Создайте различный объект |
addvariant | Добавьте вариант в модель |
sbiosteadystate | Найдите устойчивое состояние модели SimBiology |
sbioaccelerate | Подготовьте объект модели к ускоренным симуляциям |
sbiosampleparameters | Сгенерируйте параметры путем выборки ковариационной модели (требует программного обеспечения Statistics and Machine Learning Toolbox), |
sbiosampleerror | Демонстрационная ошибка на основе ошибочной модели и добавляет шум в данные моделирования |
sbioplot | Постройте результаты симуляции на одном рисунке |
sbiosubplot | Постройте результаты симуляции в подграфиках |
sbiotrellis | Отобразите на графике данные или результаты симуляции в графике решетки |
sbioensemblerun | Несколько стохастических запусков ансамбля модели SimBiology |
sbioensembleplot | Покажите результаты запуска ансамбля с помощью 2D или 3-D графиков |
sbioensemblestats | Получите статистику от данных о запуске ансамбля |
Observable | Объект, содержащий выражение для вычислений постсимуляции |
Scenarios | Сценарии симуляции |
SimFunction | Подобный функции интерфейс, чтобы выполнить модели SimBiology |
ScheduleDose | Задайте протокол дозирования препарата |
RepeatDose | Задайте протокол дозирования препарата |
Variant | Сохраните альтернативные значения компонента |
SimData | Данные моделирования |
Configset | Информация о настройках решателя для симуляции модели |
SolverOptions | Задайте опции решателя модели |
RuntimeOptions | Опции для регистрируемых разновидностей |
CompileOptions | Размерный анализ и модульные опции преобразования |
SimBiology Model Builder | Создайте QSP, PK/PD и механистические модели системной биологии в интерактивном режиме |
SimBiology Model Analyzer | Анализируйте QSP, PK/PD и механистические модели системной биологии |
Сгенерируйте демонстрационные значения для параметров модели, чтобы представлять виртуальных пациентов и симулировать, чтобы исследовать изменчивость модели.
В этом примере показано, как создать и применить вариант к модели белка G деформации дикого типа.
Симулируйте модель ответа инсулина глюкозы с различными начальными условиями
В этом примере показано, как симулировать ответы инсулина глюкозы для нормальных и диабетических предметов.
Используйте дозы, чтобы смоделировать различные режимы дозирования.
Используйте варианты, чтобы сохранить альтернативные значения параметров и начальные условия модели.
Симулируйте динамические модели с помощью различных решателей.
SimBiology® использует функцию решателя, чтобы вычислить решения для системы дифференциальных уравнений в различных временных интервалах во время симуляции модели.
Ускорение симуляций модели и исследований
Ускорьте симуляцию или анализ путем преобразования модели в скомпилированный код С.
Объедините сценарии симуляции в SimBiology
Объедините сгенерированные выборки с помощью двух различных методов.
Проблемы симуляции Поиска и устранения проблем
Диагностируйте ошибки симуляции SimBiology, такие как допуск Интегрирования не ошибка, которой соответствуют, путем изменения решателя или допусков.
Выбор абсолютной погрешности и относительной погрешности для симуляции
SimBiology использует AbsoluteTolerance
и RelativeTolerance
управлять точностью интегрирования в процессе моделирования.
Для симуляции модели SimBiology выводит обыкновенные дифференциальные уравнения (ОДУ) из реакций модели с помощью принципов массового баланса.