Exponenta Banner

genpeptread

Считайте данные из файла GenPept

Синтаксис

GenPeptData = genpeptread(File)

Аргументы

File

Любое из следующего:

  • Вектор символов или строка, задающая имя файла, путь и имя файла или URL, указывающий на файл. Файл, на который ссылаются, является GenPept-отформатированным файлом. Если вы задаете только имя файла, тот файл должен быть на пути поиска файлов MATLAB® или в Текущей папке MATLAB.

  • Символьный массив MATLAB, который содержит текст GenPept-отформатированного файла.

Совет

Можно использовать функцию getgenpept со свойством 'ToFile' получить информацию о последовательности из базы данных GenPept и создать GenPept-отформатированный файл.

GenPeptData Структура MATLAB или массив структур, содержащих полевое соответствие ключевым словам GenPept.

Описание

Примечание

NCBI изменил название их поисковой системы белка от GenPept до Белка Entrez. Однако имена функций в программном обеспечении Bioinformatics Toolbox™ (getgenpept и genpeptread) являются неизменным представлением все еще используемого формата отчета GenPept.

GenPeptData = genpeptread(File) читает GenPept-отформатированный файл, File, и создает GenPeptData, структуру или массив структур, содержа поля, соответствующие ключевым словам GenPept. Когда File содержит многократные въезды, каждая запись хранится как отдельный элемент в GenPeptData. Для списка ключевых слов GenPept см. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Sitemap/samplerecord.html.

Примеры

Получите информацию о последовательности для белка, закодированного геном HEXA, храните данные в файле, и затем читайте в программное обеспечение MATLAB.

getgenpept('p06865', 'ToFile', 'TaySachs_Protein.txt')
genpeptread('TaySachs_Protein.txt')

Смотрите также

| | | |

Представлено до R2006a

Документация Bioinformatics Toolbox
Поддержка