Класс: GTFAnnotation
Возвратите индексный массив аннотаций от объекта GTFAnnotation
Idx = getIndex(AnnotObj)
Idx = getIndex(AnnotObj,StartPos,EndPos)
Idx = getIndex(___,Name,Value)
Idx = getIndex(AnnotObj)Idx, массив целых чисел, содержащих индекс каждой аннотации в AnnotObj.
Idx = getIndex(AnnotObj,StartPos,EndPos)Idx для подмножества элементов, которое находится в пределах каждой ссылочной области значений последовательности, заданной StartPos и EndPos.
Idx = getIndex(___,Name,Value)Idx, с помощью любого из входных параметров от предыдущих синтаксисов и дополнительных опций, заданных одним или несколькими аргументами пары Name,Value.
|
Объект класса |
|
Неотрицательное целое число, задающее запуск области значений в каждой ссылочной последовательности в |
|
Неотрицательное целое число, задающее конец области значений в каждой ссылочной последовательности в |
Укажите необязательные аргументы в виде пар ""имя, значение"", разделенных запятыми. Имя (Name) — это имя аргумента, а значение (Value) — соответствующее значение. Name должен появиться в кавычках. Вы можете задать несколько аргументов в виде пар имен и значений в любом порядке, например: Name1, Value1, ..., NameN, ValueN.
|
Вектор символов, строка, представляет в виде строки вектор или массив ячеек из символьных векторов, задающий одну или несколько ссылочных последовательностей в |
|
Вектор символов, строка, представляет в виде строки вектор или массив ячеек из символьных векторов, задающий одну или несколько функций в |
|
Вектор символов, строка, представляет в виде строки вектор или массив ячеек из символьных векторов, задающий один или несколько генов в |
|
Вектор символов, строка, представляет в виде строки вектор или массив ячеек из символьных векторов, задающий одну или несколько расшифровок стенограммы в |
|
Минимальное количество основных положений, которые аннотация должна перекрыть в области значений, чтобы включать ее индекс в
Значение по умолчанию: |
|
Массив целых чисел, представляющих индексы элементов в |
Создайте объект GTFAnnotation с помощью отформатированного GTF файла, которому предоставляют Bioinformatics Toolbox™.
GTFAnnotObj = GTFAnnotation('hum37_2_1M.gtf');
Извлеките индексы аннотаций для положений 210 000 - 220 000 от ссылочной последовательности.
Idx = getIndex(GTFAnnotObj,210000,220000)
Idx =
7
15
16
17
36
47
48
49
69
70
71
89
99
111
112
113