Класс: GTFAnnotation
Получите область значений аннотаций от объекта GTFAnnotation
Range = getRange(AnnotObj)
Range = getRange(AnnotObj)Range, 1 2 числовой массив, задающий минимальные и максимальные положения в ссылочной последовательности, охваченной аннотациями в AnnotObj.
|
Объект класса |
|
1 2 числовой массив, задающий минимальные и максимальные положения в ссылочной последовательности, охвачен аннотациями в |
Создайте объект GTFAnnotation из отформатированного GTF файла, которому предоставляют Bioinformatics Toolbox™, и затем возвратите область значений аннотаций функции:
% Construct a GTFAnnotation object from a GTF file
GTFAnnotObj = GTFAnnotation('hum37_2_1M.gtf');
% Return first and last positions of reference associated with feature annotations
range = getRange(GTFAnnotObj)
range =
41609 1371382Используйте метод GTFAnnotation.getSubset с парой "имя-значение" Reference, чтобы возвратить объект GFFAnnotation, содержащий только одну ссылочную последовательность. Затем используйте этот объект из подмножества, как введено для метода getRange.