Сгенерируйте случайную последовательность от конечного алфавита
Seq = randseq(SeqLength)
Seq = randseq(SeqLength,
...'Alphabet', AlphabetValue, ...)
Seq = randseq(SeqLength,
...'Weights', WeightsValue, ...)
Seq = randseq(SeqLength,
...'FromStructure', FromStructureValue,
...)
Seq = randseq(SeqLength,
...'Case', CaseValue, ...)
Seq = randseq(SeqLength,
...'DataType', DataTypeValue, ...)
SeqLength | Целое число, которое задает количество нуклеотидов или аминокислот в случайной последовательности. |
AlphabetValue | Вектор символов или строка, которая задает алфавит для последовательности. Выбором является |
WeightsValue | Свойство задать взвешенную случайную последовательность. |
FromStructureValue | Свойство задать взвешенное случайное использование последовательности выходные структуры от функций от |
CaseValue | Вектор символов или строка, которая задает регистр букв в последовательности, когда |
DataTypeValue | Вектор символов или строка, которая задает тип данных для последовательности. Выбором является Создает последовательность как массив |
Seq = randseq(SeqLength)SeqLength.
Seq = randseq(SeqLength, ...'PropertyName', PropertyValue, ...) randseq с дополнительными свойствами, которые используют имя свойства / пары значения свойства. Можно задать одно или несколько свойств в любом порядке. Каждый PropertyName должен быть заключен в одинарные кавычки и нечувствительный к регистру. Это имя свойства / пары значения свойства следующие:
генерирует последовательность от определенного алфавита.Seq = randseq(SeqLength,
...'Alphabet', AlphabetValue, ...)
Seq = randseq(SeqLength,
...'Weights', WeightsValue, ...)i th буква от алфавита последовательности выбран с весом W(i). Вектор веса обычно является вектором вероятности или вектором подсчета частот. Обратите внимание на то, что i th элемент алфавита нуклеотида дан int2nt(i), и i th элемент алфавита аминокислоты дан int2aa(i).
Seq = randseq(SeqLength,
...'FromStructure', FromStructureValue,
...)basecount, dimercount, codoncount или aacount.
Seq = randseq(SeqLength,
...'Case', CaseValue, ...)
Seq = randseq(SeqLength,
...'DataType', DataTypeValue, ...)
Сгенерируйте случайную последовательность DNA.
randseq(20) ans = TAGCTGGCCAAGCGAGCTTG
Сгенерируйте случайную последовательность RNA.
randseq(20,'alphabet','rna') ans = GCUGCGGCGGUUGUAUCCUG
Сгенерируйте случайную последовательность белка.
randseq(20,'alphabet','amino') ans = DYKMCLYEFGMFGHFTGHKK
hmmgenerate | rand | randperm | randsample