Опции для образцовых реакций
Объект реакции представляет реакцию, которая описывает преобразование, транспорт или процесс привязки, который изменяет одну или несколько разновидностей. Как правило, изменение является суммой разновидности. Например:
Creatine + ATP <-> ADP + phosphocreatine
glucose + 2 ADP + 2 Pi -> 2 lactic acid + 2 ATP + 2 H2O
Пробелы требуются до и после имен разновидностей и стехиометрических значений.
См. Сводные данные Свойства для ссылок на страницы с описанием свойства объекта реакции.
Свойства задают характеристики объекта. Используйте get и команды set к свойствам объекта списка и измените их значения в командной строке. Можно графически изменить свойства объектов в графическом интерфейсе пользователя.
| addreaction (модель) | Создайте реакцию, возражают и добавляют к объекту модели |
| addkineticlaw (реакция) | Создайте кинетический закон, возражают и добавляют к объекту реакции |
| addproduct (реакция) | Добавьте объект разновидностей продукта в объект реакции |
| addreactant (реакция) | Добавьте объект разновидностей как реагент к объекту реакции |
| copyobj (любой объект) | Скопируйте объект SimBiology и его дочерние элементы |
| удалите (любой объект) | Объект Delete SimBiology |
| отображение (любой объект) | Отобразите сводные данные объекта SimBiology |
| доберитесь (любой объект) | Получите свойства объектов |
| getadjacencymatrix (модель) | Получите матрицу смежности от объекта модели |
| getstoichmatrix (модель) | Получите матрицу стехиометрии от объекта модели |
| переименуйте (отсек, параметр, разновидности, реакция) | Переименуйте объект и обновите выражения |
| rmproduct (реакция) | Удалите объект разновидностей из продуктов объекта реакции |
| rmreactant (реакция) | Удалите объект разновидностей из реагентов объекта реакции |
| установите (любой объект) | Установите свойства объектов |
| Активный | Укажите на объект в использовании во время симуляции |
| KineticLaw | Покажите кинетический закон, используемый для ReactionRate |
| Имя | Задайте имя объекта |
| Примечания | Текст HTML, описывающий объект SimBiology |
| Родительский элемент | Укажите на родительский объект |
| Продукты | Массив продуктов реакции |
| Реагенты | Массив реагентов реакции |
| Реакция | Реакция объекта Reaction |
| ReactionRate | Уравнение скорости реакции в объекте реакции |
| Обратимый | Задайте, обратима ли реакция или необратима |
| Стехиометрия | Коэффициенты разновидностей в реакции |
| Тег | Задайте метку для объекта SimBiology |
| Ввод | Отобразите тип объекта SimBiology |
| UserData | Задайте данные, чтобы сопоставить с объектом |
Определения и оценки реакций, AbstractKineticLaw object, Configset object, KineticLaw object, Model object, Parameter object, Root object, Rule object, Species object