Возвратите кодон нуклеотида в отображение аминокислоты для генетического кода
Map
= geneticcode
Map
= geneticcode(GeneticCode
)
GeneticCode | Целое число, вектор символов или строка, задающая номер генетического кода или кодовое название из таблицы Genetic Code. Значением по умолчанию является СоветЕсли вы используете кодовое название, можно обрезать имя к первым двум буквам имени. |
Map | Структура, содержащая отображение кодонов нуклеотида к аминокислотам для стандартного генетического кода. Map структура содержит поле для каждого кодона нуклеотида. |
возвращает структуру, содержащую отображение кодонов нуклеотида к аминокислотам для стандартного генетического кода. Map
= geneticcodeMap
структура содержит поле для каждого кодона нуклеотида.
возвращает структуру, содержащую отображение кодонов нуклеотида к аминокислотам для заданного генетического кода. Map
= geneticcode(GeneticCode
)GeneticCode
также:
Целое число, вектор символов или строка, задающая номер кода или кодовое название из таблицы Genetic Code
transl_table
(код) номер от веб-страницы NCBI, описывающей генетические коды:
Если вы используете кодовое название, можно обрезать имя к первым двум буквам имени.
Генетический код
Номер кода | Кодовое название |
---|---|
1
| Standard |
2
| Vertebrate Mitochondrial |
3
| Yeast Mitochondrial |
4
| Mold , Protozoan , Coelenterate Mitochondrial , и Mycoplasma/Spiroplasma |
5
| Invertebrate Mitochondrial |
6
| Ciliate , Dasycladacean , и Hexamita Nuclear |
9
| Echinoderm Mitochondrial |
10
| Euplotid Nuclear |
11
| Bacterial и Plant Plastid |
12
| Alternative Yeast Nuclear |
13
| Ascidian Mitochondrial |
14
| Flatworm Mitochondrial |
15
| Blepharisma Nuclear |
16
| Chlorophycean Mitochondrial |
21
| Trematode Mitochondrial |
22
| Scenedesmus Obliquus Mitochondrial |
23
| Thraustochytrium Mitochondrial |
Возвратите отображение кодонов нуклеотида к аминокислотам для Плоского червя Митохондриальный генетический код.
wormmap = geneticcode('Flatworm Mitochondrial');
[1] Веб-страница NCBI, описывающая генетические коды:
aa2nt
| aminolookup
| baselookup
| codonbias
| dnds
| dndsml
| nt2aa
| revgeneticcode
| seqshoworfs
| seqviewer