gprread

Считайте микроданные массива из Результатов GenePix (GPR) файл

свернуть все на странице

Синтаксис

GPRData = gprread(File)
gprread(..., 'PropertyName', PropertyValue,...)
gprread(..., 'CleanColNames', CleanColNamesValue)

Аргументы

File

GenePix® Results (GPR) отформатировал файл. Введите вектор символов или строку, задающую имя файла, или путь и имя файла.

CleanColNamesValue

Управляет созданием имен столбцов, которые могут использоваться в качестве имен переменных.

Описание

GPRData = gprread(File) считывает данные о результатах GenePix из File и создает структуру MATLAB® (GPRData).

gprread(..., 'PropertyName', PropertyValue,...) задает дополнительные свойства с помощью имени свойства / пары значения.

gprread(..., 'CleanColNames', CleanColNamesValue) управляет созданием имен столбцов, которые могут использоваться в качестве имен переменных. Файл GPR может содержать имена столбцов с пробелами и некоторыми символами, которые программное обеспечение MATLAB не может использовать на имена переменной MATLAB. Если CleanColNamesValue true, gprread возвращает имена в поле ColumnNames это - допустимые имена переменной MATLAB и имена, которые можно использовать в функциях. По умолчанию, CleanColNamesValue false и поле ColumnNames может содержать символы, которые недопустимы для имен переменной MATLAB.

Поле Indices из структуры содержит индексы, которые могут использоваться для графического вывода карт тепла данных.

Для получения дополнительной информации о формате GPR смотрите

https://mdc.custhelp.com/app/answers/detail/a_id/18883/kw/file%20format

Функция поддерживает версии 3, 4 и 5 из Формата Результатов GenePix.

Примеры

свернуть все

Скрипт Open Live Script

В этом примере показано, как считать и отобразить данные из результата GenePix® (GPR) файл.

Читайте в демонстрационном файле GPR.

gprStruct = gprread('mouse_a1pd.gpr')
gprStruct = struct with fields:
         Header: [1x1 struct]
           Data: [9504x38 double]
         Blocks: [9504x1 double]
        Columns: [9504x1 double]
           Rows: [9504x1 double]
          Names: {9504x1 cell}
            IDs: {9504x1 cell}
    ColumnNames: {38x1 cell}
        Indices: [132x72 double]
          Shape: [1x1 struct]

Постройте среднюю приоритетную интенсивность для канала на 635 нм.

maimage(gprStruct,'F635 Median')

Figure contains an axes. The axes with title F635 Median contains 5 objects of type image, line.

Смотрите также

| | | | | | | | |

Представлено до R2006a

Документация Bioinformatics Toolbox

Поддержка

Для просмотра документации необходимо авторизоваться на сайте