Функции масс-спектрометрии предварительно обрабатывают и классифицируют необработанные данные от SELDI-TOF и спектрометров MALDI-TOF и используют статистические функции изучения, чтобы идентифицировать шаблоны.
Чтение необработанных данных — масса/заряд сырых данных Загрузки и ионные данные об интенсивности из файлов "запятой разделила значение" (CSV), или считало файл JCAMP-DX-formatted с данными о масс-спектрометрии (jcampread
) в среду MATLAB®.
Вы можете также иметь данные в файлах TXT и использовать importdata
функция.
Предварительная обработка необработанных данных — Передискретизирует данные с высоким разрешением к более низкому разрешению (msresample
) где дополнительные точки данных не нужны. Откорректируйте базовую линию (msbackadj
). Выровняйте спектр к набору ссылочных масс (msalign
) и визуально проверьте выравнивание (msheatmap
). Нормируйте область между спектрами для сравнения (msnorm
), и отфильтруйте шум (mslowess
и mssgolay
).
Анализ спектра — спектры Загрузки в графический интерфейс пользователя (msviewer
) для выбора массового peaks и последующего анализа.
Следующая диаграмма иллюстрирует роли различных функций масс-спектрометрии в тулбоксе.