SimBiology обеспечивает набор интегрированных приложений, которые спроектированы, чтобы упростить создание, симуляцию и анализ моделей динамических систем, таких как количественная системная фармакология (QSP), фармакокинетическая/фармакодинамическая модели системной биологии и (PK/PD).
Приложение SimBiology Model Builder позволяет вам создать динамические модели в интерактивном режиме с помощью различных элементов моделирования. Например, можно смоделировать множество биологических систем, таких как сигнальные трассы, метаболические сети, PBPK, QSP и модели PK/PD. Это также позволяет вам биологическая изменчивость модели и различные режимы дозирования, чтобы исследовать различные экспериментальные условия и стратегии дозирования.
Приложение SimBiology Model Analyzer позволяет вам выполнить исследования моделей динамических систем. Можно симулировать динамическое поведение модели с помощью различных решателей и оценить параметры модели. Чтобы исследовать системную динамику и экспериментирование руководства, можно выполнить развертки параметра и анализ чувствительности.
| SimBiology Model Builder | Создайте QSP, PK/PD и механистические модели системной биологии в интерактивном режиме |
| SimBiology Model Analyzer | Анализируйте QSP, PK/PD и механистические модели системной биологии |
simbio.diagram.getBlock | Получите свойства блока схемы SimBiology |
simbio.diagram.setBlock | Установите свойства блока схемы SimBiology |
simbio.diagram.getLine | Получите свойства линии схемы SimBiology |
simbio.diagram.setLine | Установите свойства линии схемы SimBiology |
simbio.diagram.splitBlock | Разделите блок разновидностей SimBiology в схеме |
simbio.diagram.joinBlock | Объедините все копии блоков разновидностей SimBiology в схеме |
Создайте модель кинетики лиганда приемника
В этом примере показано, как создать и симулировать простую модель кинетики лиганда приемника с помощью приложений SimBiology Model Analyzer и SimBiology Model Builder.
Включите котранспортер глюкозы натрия 2 ингибирования приемника (SGLT2) гипотетическим составным объектом в существующую модель инсулина глюкозы.
Скопируйте и вставьте блоки SimBiology при создавании моделей в Схеме.
Горячие клавиши для SimBiology Model Builder
Приложение SimBiology Model Builder обеспечивает горячие клавиши для различных действий моделирования.
Библиотеки компонента модели SimBiology
Библиотеки SimBiology® являются наборами встроенных компонентов, которые можно использовать, чтобы создать и анализировать модели.
Передайте значки индикатора в SimBiology Model Builder
Приложение SimBiology Model Builder использует контекстные значки, чтобы предоставить больше информации о компонентах модели в таблицах браузера и блоках во вкладке Diagram.
Отмените и восстановите изменения модели в SimBiology
Можно отменить и восстановить действия, связанные с построением моделей и конфигурирующий свойства блока.
Выполните неразделенный на отсеки анализ и калибруйте параметры модели путем подбора кривой к экспериментальным данным PKPD с помощью нелинейной регрессии.
Найдите важные параметры с анализом чувствительности Используя приложение SimBiology Model Analyzer
Выполните анализ чувствительности, чтобы найти важные параметры модели.
Сгенерируйте демонстрационные значения для параметров модели, чтобы представлять виртуальных пациентов и симулировать, чтобы исследовать изменчивость модели.
Отсканируйте режимы дозирования Используя приложение SimBiology Model Analyzer
Исследуйте несколько объемов дозирования, которые соответствуют порогам эффективности и токсичности.
