Биоинформатика Toolbox™ предоставляет алгоритмы и приложения для секвенирования следующего поколения (NGS), анализа микрочипов, масс-спектрометрии и онтологии генов. Используя функции панели инструментов, можно считывать геномные и протеомные данные из стандартных форматов файлов, таких как SAM, FASTA, CEL и CDF, а также из онлайн-баз данных, таких как NCBI Gene Expression Omnibus и GenBank ®. Можно исследовать и визуализировать эти данные с помощью браузеров последовательностей, пространственных тепловых карт и кластерграмм. Панель инструментов также предоставляет статистические методы для обнаружения пиков, вычисления значений для отсутствующих данных и выбора элементов.
Можно комбинировать функции панели инструментов для поддержки общих рабочих процессов биоинформатики. Можно использовать данные ChIP-Seq для идентификации факторов транскрипции; анализировать данные RNA-Seq для идентификации дифференциально экспрессируемых генов; идентифицировать варианты номера копии и SNP в данных микрочипов; и классифицируют белковые профили с использованием данных масс-спектрометрии.
Изучение основ инструментария биоинформатики
Экспрессия генов, фактор транскрипции и анализ метилирования данных секвенирования следующего поколения (NGS), включая РНК-Seq и ChIP-Seq
Экспрессия генов и анализ генетических вариантов данных микрочипов
Геномные и протеомные последовательности, выравнивание и филогенетика
Визуализировать и манипулировать 3-D структурами белков и других биомолекул; Прогнозирование и визуализация вторичной структуры РНК
Данные методов разделения, которые дают следы с пиками, включая MS, LC/MS, ЯМР, хроматографию и электрофорез