Класс: BioMap
Получение начальных позиций выровненных последовательностей чтения из BioMap объект
Start = getStart(BioObj)
Start = getStart(BioObj, Subset)
Start = getStart(BioObj)Startвектор целых чисел, задающий начальное положение выровненных считанных последовательностей относительно номеров позиций в ссылочной последовательности из BioMap объект.
Start = getStart(BioObj, Subset)Subset.
|
Объект |
|
Одно из следующих действий для указания подмножества элементов в
Примечание Если для указания используется массив заголовков ячеек |
|
|
Построить BioMap и затем извлеките начальную позицию для различных последовательностей в объекте:
% Construct a BioMap object from a SAM file
BMObj1 = BioMap('ex1.sam');
% Retrieve the start property of the second element in the object
Start_2 = getStart(BMObj1, 2)Start_2 =
3% Retrieve the start properties of the first and third elements in % the object Start_1_3 = getStart(BMObj1, [1 3])
Start_1_3 =
1
5% Retrieve the start properties of all elements in the object Start_All = getStart(BMObj1);
Альтернатива использованию getStart метод заключается в использовании индексации точек с помощью Start свойство:
BioObj.Start(Indices)
В предыдущем синтаксисе Indices - вектор положительных целых чисел или логический вектор. Indices не может быть массивом ячеек символьных векторов или строковых векторов, содержащих заголовки последовательностей.