Рассчитать диапазон профилей экспрессии генов
Range = exprprofrange(Data)
[Range, LogRange] = exprprofrange(Data)
... = exprprofrange(Data, 'ShowHist', ShowHistValue)
Data | объект DataMatrix или числовая матрица значений экспрессии, где каждая строка соответствует гену. |
ShowHistValue | Управляет отображением гистограммы с данными диапазона. Значение по умолчанию:
|
Range = exprprofrange(Data)Dataобъект DataMatrix или числовая матрица значений экспрессии, где каждая строка соответствует гену.
[ возвращает диапазон журнала, т. е. Range, LogRange] = exprprofrange(Data)log(max(prof))- log(min(prof)), каждого профиля выражения. Если выходные аргументы не указаны, exprprofrange отображает гистограммный штрих-график диапазона.
... = exprprofrange( управляет отображением гистограммы с данными диапазона. Варианты для Data, 'ShowHist', ShowHistValue)ShowHistValue являются true или false.
Загрузить данные микрочипов, содержащие уровни экспрессии генов Saccharomyces cerevisiae (дрожжи).
load yeastdataЭтот MAT-файл включает три переменные, которые добавляются в рабочую область MATLAB ®:
yeastvalues - Матрица данных экспрессии генов
гены - клеточный массив регистрационных номеров GenBank ® для маркировки строк в дрожжевых значениях
times - вектор значений времени для маркировки столбцов в дрожжевых значениях;
Рассчитайте диапазон профилей экспрессии для дрожжевых данных по мере изменения экспрессии генов во время метаболического сдвига от ферментации к дыханию. И отобразить гистограмму данных.
range = exprprofrange(yeastvalues,'ShowHist',true);