exponenta event banner

exprprofvar

Рассчитать дисперсию профилей экспрессии генов

Синтаксис

Variance = exprprofvar(Data)
exprprofvar(..., 'PropertyName', PropertyValue,...)
exprprofvar(..., 'ShowHist', ShowHistValue)

Аргументы

Data

объект DataMatrix или числовая матрица значений экспрессии, где каждая строка соответствует гену.

ShowHistValue

Управляет отображением гистограммы с данными дисперсии. Значение по умолчанию:

  • false - Когда указаны выходные значения.

  • true - Когда выходные значения не указаны.

Описание

Variance = exprprofvar(Data) вычисляет дисперсию каждого профиля выражения в Dataобъект DataMatrix или числовая матрица значений экспрессии, где каждая строка соответствует гену. Если выходные аргументы не указаны, эта функция отображает гистограммный график диапазона.

exprprofvar(..., 'PropertyName', PropertyValue,...) определяет дополнительные свойства, используя пары имя/значение свойства.

exprprofvar(..., 'ShowHist', ShowHistValue) управляет отображением гистограммы с данными диапазона. Варианты для ShowHistValue являются true или false.

Примеры

свернуть все

Загрузить данные микрочипов, содержащие уровни экспрессии генов Saccharomyces cerevisiae (дрожжи).

load yeastdata

Этот MAT-файл включает три переменные, которые добавляются в рабочую область MATLAB ®:

  • yeastvalues - Матрица данных экспрессии генов

  • гены - клеточный массив регистрационных номеров GenBank ® для маркировки строк в дрожжевых значениях

  • times - вектор значений времени для маркировки столбцов в дрожжевых значениях;

Рассчитайте дисперсию профилей экспрессии для дрожжевых данных по мере изменения экспрессии генов во время метаболического сдвига от ферментации к дыханию. И отобразить гистограмму данных.

range = exprprofvar(yeastvalues,'ShowHist',true);

Figure contains an axes. The axes with title Profile Variances contains an object of type patch. This object represents absvar.

Представлен до R2006a