Объект DataMatrix

Структура данных, инкапсулирующая данные и метаданные из эксперимента с микрочипами, чтобы их можно было индексировать по идентификаторам генов или зондов и по идентификаторам образцов

Описание

Объект DataMatrix представляет собой структуру данных, инкапсулирующую данные измерений и метаданные признаков из эксперимента с микрочипами, так что его можно индексировать по идентификаторам генов или зондов и по идентификаторам образцов. Объект DataMatrix хранит экспериментальные данные в матрице со строками, обычно соответствующими именам генов или идентификаторам зондов, и столбцами, обычно соответствующими идентификаторам образцов. Объект DataMatrix также хранит метаданные, такие как имена генов или идентификаторы зондов и идентификаторов образцов, в именах строк и столбцов.

Объект DataMatrix создается с помощью функции конструктора объекта DataMatrix.

Сводка по свойствам

Свойства объекта DataMatrix

Собственность	Описание
`Name`	Символьный вектор, описывающий объект DataMatrix. По умолчанию: `''`.
`RowNames`	Пустой массив или массив ячеек символьных векторов, указывающих имена строк, обычно имена генов или идентификаторы зондов. Число элементов в массиве ячеек должно быть равно количеству строк в матрице. По умолчанию используется пустой массив.
`ColNames`	Пустой массив или массив ячеек символьных векторов, указывающих имена столбцов, как правило, идентификаторы образцов. Число элементов в массиве ячеек должно быть равно количеству столбцов в матрице.
`NRows`	Только для чтения. Положительное число, указывающее количество строк в матрице. Примечание Невозможно изменить это свойство напрямую. Доступ к нему можно получить с помощью `get` способ.
`NCols`	Только для чтения. Положительное число, указывающее количество столбцов в матрице. Примечание Невозможно изменить это свойство напрямую. Доступ к нему можно получить с помощью `get` способ.
`NDims`	Только для чтения. Положительное число, указывающее количество размеров в матрице. Примечание Невозможно изменить это свойство напрямую. Доступ к нему можно получить с помощью `get` способ.
`ElementClass`	Только для чтения. Символьный вектор, указывающий тип класса элементов в объекте DataMatrix, например `single` или `double`. Примечание Невозможно изменить это свойство напрямую. Доступ к нему можно получить с помощью `get` способ.

Сводка по методу

Общие методы объекта DataMatrix

Метод	Описание
`colnames`	Получение или установка имен столбцов объекта DataMatrix.
`disp`	Отобразить объект DataMatrix.
`display`	Отображение объекта DataMatrix, печать имени объекта DataMatrix. Чтобы вызвать этот метод, введите имя объекта DataMatrix в командной строке.
`dmwrite`	Запись объекта DataMatrix в текстовый файл.
`double`	Преобразовать объект DataMatrix в массив с двойной точностью.
`get`	Получение информации об объекте DataMatrix.
`isempty`	Определите, пуст ли объект DataMatrix.
`isfinite`	Определите, являются ли элементы объекта DataMatrix конечными.
`isinf`	Определите, являются ли элементы объекта DataMatrix бесконечными.
`isnan`	Определите, являются ли элементы объекта DataMatrix элементами NaN.
`isscalar`	Определите, является ли объект DataMatrix скалярным.
`isequal`	Проверка объектов DataMatrix на равенство.
`isequaln`	Проверьте объекты DataMatrix на равенство, рассматривая NaNs как равные.
`isvector`	Определите, является ли объект DataMatrix векторным.
`length`	Возвращаемая длина объекта DataMatrix.
`ndims`	Возвращает число измерений в объекте DataMatrix.
`numel`	Возвращает число элементов в объекте DataMatrix.
`plot`	Постройте график 2-D линии объекта DataMatrix.
`rownames`	Получение или установка имен строк объекта DataMatrix.
`set`	Задать свойство объекта DataMatrix.
`single`	Преобразовать объект DataMatrix в массив с одной точностью.
`size`	Возвращает размер объекта DataMatrix.

Методы управления данными в объекте DataMatrix

Метод	Описание
`cat`	Объединение объектов DataMatrix. `horzcat` и `vertcat` методы реализуют особые случаи.
`horzcat`	Объединение объектов DataMatrix по горизонтали.
`sortcols`	Сортировка столбцов объекта DataMatrix по возрастанию или убыванию.
`sortrows`	Сортировка строк объекта DataMatrix по возрастанию или убыванию.
`subsasgn`	Подстрочное назначение для объекта DataMatrix. Чтобы вызвать этот метод, используйте круглые скобки или точечное индексирование, описанное в разделе Доступ к данным в объектах DataMatrix.
`subsref`	Подстрочная ссылка для объекта DataMatrix. Чтобы вызвать этот метод, используйте круглые скобки или точечное индексирование, описанное в разделе Доступ к данным в объектах DataMatrix.
`transpose`	Объект Transpose DataMatrix.
`vertcat`	Объединение объектов DataMatrix по вертикали.

Описательная статистика и методы статистического обучения

Метод	Описание
`kmeans`	K-означает кластеризацию.
`max`	Возвращает максимальные значения в объекте DataMatrix.
`mean`	Возвращает среднее или среднее значение в объекте DataMatrix.
`median`	Возвращает медианные значения в объекте DataMatrix.
`min`	Возвращает минимальные значения в объекте DataMatrix.
`nanmax`	Возвращает максимальные значения в объекте DataMatrix, игнорируя значения NaN.
`nanmean`	Возвращает среднее или среднее значение в объекте DataMatrix, игнорирующем значения NaN.
`nanmedian`	Возвращает медианные значения в объекте DataMatrix с игнорированием значений NaN.
`nanmin`	Возвращает минимальные значения в объекте DataMatrix, игнорируя значения NaN.
`nanstd`	Возвращает значения стандартного отклонения в объекте DataMatrix с игнорированием значений NaN.
`nansum`	Возвращает сумму элементов в объекте DataMatrix, игнорирующих значения NaN.
`nanvar`	Возвращает значения расхождений в объекте DataMatrix с игнорированием значений NaN.
`pca`	Анализ основных компонентов данных.
`pdist`	Попарное расстояние.
`std`	Возвращает значения стандартного отклонения в объекте DataMatrix.
`sum`	Возвращает сумму элементов в объекте DataMatrix.
`var`	Возвращает значения расхождений в объекте DataMatrix.

Унарные методы - экспоненциальные

Метод	Описание
`exp`	Экспоненциальный.
`log`	Натуральный логарифм.
`log10`	Общий (основание 10) логарифм.
`log2`	Используйте логарифм 2 и разбейте числа с плавающей запятой на экспоненту и мантиссу.
`pow2`	Базовые 2 числа мощности и масштаба с плавающей запятой.
`sqrt`	Квадратный корень.

Унарные методы - целое число

Метод	Описание
`ceil`	Округлите объект DataMatrix до бесконечности.
`fix`	Скругление объекта DataMatrix до нуля.
`floor`	Округлите объект DataMatrix до минус бесконечности.
`round`	Округление объекта DataMatrix до ближайшего целого числа.

Унарные методы - пользовательские

Метод	Описание
`dmarrayfun`	Примените функцию к каждому элементу объекта DataMatrix.

Двоичные методы - арифметический оператор

Оператор	Метод	Описание
`+`	`plus`	Добавление объектов DataMatrix
`-`	`minus`	Вычитание объектов DataMatrix.
`.*`	`times`	Умножение объектов DataMatrix.
`./`	`rdivide`	Правый массив разделяет объекты DataMatrix.
`.\`	`ldivide`	Левый массив разделяет объекты DataMatrix.
`.^`	`power`	Объекты DataMatrix мощности массива.

Двоичные методы - реляционный оператор

Оператор	Метод	Описание
`<`	`lt`	Проверка объектов DataMatrix менее.
`<=`	`le`	Проверка объектов DataMatrix на значение, меньшее или равное.
`>`	`gt`	Проверка объектов DataMatrix на значение больше.
`>=`	`ge`	Проверка объектов DataMatrix на значение, большее или равное.
`==`	`eq`	Проверка объектов DataMatrix на равенство.
`~=`	`ne`	Проверка объектов DataMatrix на неравенство.

Двоичные методы - пользовательские

Метод	Описание
`dmbsxfun`	Примените поэлементную двоичную операцию к двум объектам DataMatrix с включенным одноэлементным расширением.

Примеры

Пример 5. Определение свойств и значений свойств объекта DataMatrix

Можно отобразить все свойства и их текущие значения объекта DataMatrix, DMobj, используя следующий синтаксис:

get(DMobj)

Можно вернуть все свойства и их текущие значения DMobj, объект DataMatrix, в DMstructскалярная структура, в которой каждое имя поля является свойством объекта DataMatrix, и каждое поле содержит значение этого свойства, используя следующий синтаксис:

DMstruct = get(DMobj)

Можно вернуть значение определенного свойства объекта DataMatrix, DMobj, используя любой из следующих синтаксисов:

PropertyValue = get(DMObj, 'PropertyName')

PropertyValue = DMObj.PropertyName

Можно вернуть значение определенных свойств объекта DataMatrix, DMobj, используя следующий синтаксис:

[Property1Value, Property2Value, ...] = get(DMobj, ...
'Property1Name', 'Property2Name', ...)

Пример 6. Определение возможных значений свойств объекта DataMatrix

Можно отобразить возможные значения для всех свойств, имеющих фиксированный набор значений свойств в объекте DataMatrix. DMobj, используя следующий синтаксис:

set(DMobj)

В объекте DataMatrix можно отобразить возможные значения для определенного свойства, имеющего фиксированный набор значений свойств. DMobj, используя следующий синтаксис:

set(DMObj,  'PropertyName')

Пример 7. Задание свойств объекта DataMatrix

Можно задать определенное свойство объекта DataMatrix, DMObj, используя любой из следующих синтаксисов:

DMObj = set(DMObj,  'PropertyName', PropertyValue)

DMObj.PropertyName = PropertyValue

Можно задать несколько свойств объекта DataMatrix, DMobj, используя следующий синтаксис:

set(DMobj,  'PropertyName1', PropertyValue1, ...
    'PropertyName2', PropertyValue2, ...)

Примечание

Дополнительные примеры создания и использования объектов DataMatrix см. в разделе Представление значений данных выражения в объектах DataMatrix.

Вопросы совместимости

развернуть все

`princomp` метод был переименован

Ошибки, начинающиеся с R2017b

princomp способ DataMatrix object был переименован. Заменить экземпляры princomp с pca.

См. также

Представлен в R2008b

Документация

Объект DataMatrix

Описание

Сводка по свойствам

Сводка по методу

Примеры

Вопросы совместимости

`princomp` метод был переименован

См. также

Документация по инструментарию биоинформатики

Поддержка

Документация

Объект DataMatrix

Описание

Сводка по свойствам

Сводка по методу

Примеры

Вопросы совместимости

princomp метод был переименован

См. также

Документация по инструментарию биоинформатики

Поддержка

`princomp` метод был переименован