Вернуть матрицу оценки Гоннета
gonnet
gonnet возвращает матрицу Гоне.
Матрица Гонне является рекомендованной мутационной матрицей для первоначального выравнивания белковых последовательностей. Матричные элементы в десять раз больше логарифмической вероятности выравнивания остатков, деленной на вероятность случайного выравнивания остатков, и затем матричные элементы нормализуются до 250 единиц PAM.
Ожидаемый балл = -0.6152, Энтропия = 1.6845 биты, наименьший балл = -8, Наивысший балл = 14.2
Заказ:
A R N D C Q E G H I L K M F P S T W Y V B Z X *
Гастон, Х., Гонне, М., Коэн, А. и Беннер, С. (1992). Исчерпывающее сопоставление всей базы данных последовательностей белков. Наука. 256, 1443–1445.