sbiosimulate | Моделирование модели SimBiology |
createSimFunction | Создать объект SimFunction |
sbiodose | Построить дозовый объект |
adddose | Добавление объекта дозы в модель |
addobservable | Добавление наблюдаемого объекта в модель SimBiology |
sbiovariant | Объект варианта конструкции |
addvariant | Добавление варианта в модель |
sbiosteadystate | Поиск устойчивого состояния модели SimBiology |
sbioaccelerate | Подготовка объекта модели к ускоренному моделированию |
sbiosampleparameters | Создание параметров путем выборки ковариатной модели (требуется программное обеспечение Statistics and Machine Learning Toolbox) |
sbiosampleerror | Пример ошибки на основе модели ошибки и добавление шума в данные моделирования |
sbioplot | Результаты моделирования печати на одном рисунке |
sbiosubplot | Результаты моделирования печати на вложенных графиках |
sbiotrellis | Данные графика или результаты моделирования на решетчатом графике |
sbioensemblerun | Несколько стохастических ансамблевых прогонов модели SimBiology |
sbioensembleplot | Показать результаты выполнения ансамбля с использованием 2-D или 3-D графиков |
sbioensemblestats | Получение статистики из данных выполнения ансамбля |
Observable | Объект, содержащий выражение для расчетов после моделирования |
Scenarios | Сценарии моделирования |
SimFunction | Функциональный интерфейс для выполнения моделей SimBiology |
ScheduleDose | Определение протокола дозирования лекарств |
RepeatDose | Определение протокола дозирования лекарств |
Variant | Сохранение значений альтернативных компонентов |
SimData | Данные моделирования |
Configset | Сведения о настройках решателя для моделирования модели |
SolverOptions | Задание параметров решателя модели |
RuntimeOptions | Параметры для протоколируемых видов |
CompileOptions | Параметры анализа размеров и преобразования единиц измерения |
| Построитель моделей SimBiology | Создание моделей QSP, PK/PD и механистической системной биологии в интерактивном режиме |
| Анализатор модели SimBiology | Анализ моделей QSP, PK/PD и механистической системной биологии |
Создайте выборочные значения для параметров модели, чтобы представить виртуальных пациентов, и смоделируйте для изучения изменчивости модели.
В этом примере показано, как создать и применить вариант к G-белковой модели штамма дикого типа.
Моделирование модели глюкозно-инсулиновой реакции с различными исходными условиями
Этот пример показывает, как моделировать глюкозно-инсулиновые реакции для нормальных и диабетических субъектов.
Используйте дозы для моделирования различных режимов дозирования.
Используйте варианты для хранения значений альтернативных параметров и начальных условий модели.
Моделирование динамических моделей с использованием различных решателей.
Выбор вычислителя моделирования
SimBiology ® использует функцию решателя для вычисления решений для системы дифференциальных уравнений с различными временными интервалами во время моделирования модели.
Ускорение моделирования и анализа моделей
Ускорение моделирования или анализа путем преобразования модели в скомпилированный код C.
Комбинирование сценариев моделирования в SimBiology
Объединение сгенерированных проб двумя различными методами.
Устранение неполадок моделирования
Устраните ошибки моделирования SimBiology, такие как ошибка «Допуск интеграции не удовлетворен» (Integration tolerance not met error), путем изменения решателя или допусков.
Выбор абсолютного и относительного допусков для моделирования
SimBiology использует AbsoluteTolerance и RelativeTolerance для контроля точности интегрирования во время моделирования.
Для моделирования модели SimBiology выводит обычные дифференциальные уравнения (ОДУ) из модельных реакций с использованием принципов баланса масс.